Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MMP13P45452 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP13P45452 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP13P45452 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP13P45452 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP13P45452 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP13P45452 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP13P45452 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP13P45452 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP13P45452 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP13P45452 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP13P45452 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP13P45452 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP13P45452 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP13P45452 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP13P45452 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP13P45452 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP13P45452 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP13P45452 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP13P45452 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP13P45452 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP13P45452 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP13P45452 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP13P45452 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP13P45452 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP13P45452 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP13P45452 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP13P45452 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP13P45452 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP13P45452 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP13P45452 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP13P45452 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP13P45452 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP13P45452 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP13P45452 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP13P45452 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP13P45452 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP13P45452 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP13P45452 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP13P45452 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP13P45452 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP13P45452 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP13P45452 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP13P45452 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP13P45452 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP13P45452 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP13P45452 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP13P45452 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP13P45452 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP13P45452 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP13P45452 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP13P45452 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP13P45452 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP13P45452 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP13P45452 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP13P45452 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP13P45452 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP13P45452 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP13P45452 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP13P45452 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP13P45452 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP13P45452 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms