Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms