Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 YDL012CYDL012C 324 nt4.57□□□□□ -1.68
NDI1P32340 ARC1YGL105W 1131 nt4.57□□□□□ -1.68
NDI1P32340 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt4.57□□□□□ -1.68
NDI1P32340 YJL220WYJL220W 453 nt4.57□□□□□ -1.68
NDI1P32340 LSO1YJR005C-A 282 nt4.57□□□□□ -1.68
NDI1P32340 YNL134CYNL134C 1131 nt4.57□□□□□ -1.68
NDI1P32340 BUD17YNR027W 954 nt4.57□□□□□ -1.68
NDI1P32340 YOL050CYOL050C 321 nt4.57□□□□□ -1.68
NDI1P32340 OPY2YPR075C 1083 nt4.57□□□□□ -1.68
NDI1P32340 AKL1YBR059C 3327 nt4.57□□□□□ -1.68
NDI1P32340 STP4YDL048C 1473 nt4.56□□□□□ -1.68
NDI1P32340 KAP114YGL241W 3015 nt4.56□□□□□ -1.68
NDI1P32340 MCM21YDR318W 1107 nt4.56□□□□□ -1.68
NDI1P32340 DSD1YGL196W 1287 nt4.56□□□□□ -1.68
NDI1P32340 COA3YJL062W-A 258 nt4.56□□□□□ -1.68
NDI1P32340 TEF4YKL081W 1239 nt4.56□□□□□ -1.68
NDI1P32340 PRM9YAR031W 897 nt4.56□□□□□ -1.68
NDI1P32340 RAD17YOR368W 1206 nt4.56□□□□□ -1.68
NDI1P32340 ECM32YER176W 3366 nt4.56□□□□□ -1.68
NDI1P32340 LYS2YBR115C 4179 nt4.56□□□□□ -1.68
NDI1P32340 TRE1YPL176C 2352 nt4.55□□□□□ -1.68
NDI1P32340 ERV14YGL054C 417 nt4.55□□□□□ -1.68
NDI1P32340 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.55□□□□□ -1.68
NDI1P32340 YPL114WYPL114W 420 nt4.55□□□□□ -1.68
NDI1P32340 HIS4YCL030C 2400 nt4.55□□□□□ -1.68
NDI1P32340 YER158CYER158C 1722 nt4.55□□□□□ -1.68
NDI1P32340 MSC2YDR205W 2175 nt4.54□□□□□ -1.68
NDI1P32340 HUL4YJR036C 2679 nt4.54□□□□□ -1.68
NDI1P32340 NMD3YHR170W 1557 nt4.54□□□□□ -1.68
NDI1P32340 SPR6YER115C 576 nt4.54□□□□□ -1.68
NDI1P32340 YGR016WYGR016W 573 nt4.54□□□□□ -1.68
NDI1P32340 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.54□□□□□ -1.68
NDI1P32340 CIA2YHR122W 696 nt4.54□□□□□ -1.68
NDI1P32340 PDX3YBR035C 687 nt4.54□□□□□ -1.68
NDI1P32340 NAT3YPR131C 588 nt4.54□□□□□ -1.68
NDI1P32340 RTC1YOL138C 4026 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 TDA11YHR159W 1515 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 STB2YMR053C 2553 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 YER085CYER085C 522 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 YIL086CYIL086C 309 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 YIL165CYIL165C 360 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 CIN5YOR028C 888 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 MEF2YJL102W 2460 nt4.53□□□□□ -1.68
NDI1P32340 LAP3YNL239W 1365 nt4.53□□□□□ -1.69
NDI1P32340 YDR444WYDR444W 2064 nt4.52□□□□□ -1.69
NDI1P32340 GGA1YDR358W 1674 nt4.52□□□□□ -1.69
NDI1P32340 SUR2YDR297W 1050 nt4.52□□□□□ -1.69
NDI1P32340 PFA5YDR459C 1125 nt4.52□□□□□ -1.69
NDI1P32340 RPL34AYER056C-A 366 nt4.52□□□□□ -1.69
NDI1P32340 UBI4YLL039C 1146 nt4.52□□□□□ -1.69
NDI1P32340 SNO1YMR095C 675 nt4.52□□□□□ -1.69
NDI1P32340 MDR1YGR100W 2853 nt4.52□□□□□ -1.69
NDI1P32340 OCT1YKL134C 2319 nt4.52□□□□□ -1.69
NDI1P32340 GAS4YOL132W 1416 nt4.52□□□□□ -1.69
NDI1P32340 NNK1YKL171W 2787 nt4.51□□□□□ -1.69
NDI1P32340 MSE1YOL033W 1611 nt4.51□□□□□ -1.69
NDI1P32340 PAD1YDR538W 729 nt4.51□□□□□ -1.69
NDI1P32340 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.51□□□□□ -1.69
NDI1P32340 ERG26YGL001C 1050 nt4.51□□□□□ -1.69
NDI1P32340 MPC1YGL080W 393 nt4.51□□□□□ -1.69
NDI1P32340 YIL163CYIL163C 354 nt4.51□□□□□ -1.69
NDI1P32340 CCS1YMR038C 750 nt4.51□□□□□ -1.69
NDI1P32340 YIM1YMR152W 1098 nt4.51□□□□□ -1.69
NDI1P32340 CKS1YBR135W 453 nt4.51□□□□□ -1.69
NDI1P32340 EAR1YMR171C 1653 nt4.51□□□□□ -1.69
NDI1P32340 RGP1YDR137W 1992 nt4.51□□□□□ -1.69
NDI1P32340 YGR266WYGR266W 2106 nt4.51□□□□□ -1.69
NDI1P32340 COQ4YDR204W 1008 nt4.5□□□□□ -1.69
NDI1P32340 RMD5YDR255C 1266 nt4.5□□□□□ -1.69
NDI1P32340 YDR274CYDR274C 372 nt4.5□□□□□ -1.69
NDI1P32340 RNA15YGL044C 891 nt4.5□□□□□ -1.69
NDI1P32340 YHL049CYHL049C 816 nt4.5□□□□□ -1.69
NDI1P32340 CPR6YLR216C 1116 nt4.5□□□□□ -1.69
NDI1P32340 RPP0YLR340W 939 nt4.5□□□□□ -1.69
NDI1P32340 PCL1YNL289W 840 nt4.5□□□□□ -1.69
NDI1P32340 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.5□□□□□ -1.69
NDI1P32340 SAF1YBR280C 1914 nt4.5□□□□□ -1.69
NDI1P32340 ZPR1YGR211W 1461 nt4.49□□□□□ -1.69
NDI1P32340 SWC3YAL011W 1878 nt4.49□□□□□ -1.69
NDI1P32340 ZRC1YMR243C 1329 nt4.49□□□□□ -1.69
NDI1P32340 SKM1YOL113W 1968 nt4.49□□□□□ -1.69
NDI1P32340 KTR7YIL085C 1554 nt4.49□□□□□ -1.69
NDI1P32340 ABF1YKL112W 2196 nt4.49□□□□□ -1.69
NDI1P32340 HOT1YMR172W 2160 nt4.49□□□□□ -1.69
NDI1P32340 KIN28YDL108W 921 nt4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.6 ms