Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA4P22748 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA4P22748 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA4P22748 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA4P22748 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA4P22748 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA4P22748 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA4P22748 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA4P22748 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA4P22748 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA4P22748 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA4P22748 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA4P22748 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA4P22748 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA4P22748 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA4P22748 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA4P22748 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CA4P22748 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA4P22748 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA4P22748 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CA4P22748 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA4P22748 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA4P22748 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA4P22748 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA4P22748 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA4P22748 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA4P22748 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA4P22748 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA4P22748 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA4P22748 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA4P22748 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA4P22748 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA4P22748 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA4P22748 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA4P22748 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA4P22748 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA4P22748 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA4P22748 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CA4P22748 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA4P22748 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA4P22748 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA4P22748 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA4P22748 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA4P22748 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA4P22748 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA4P22748 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA4P22748 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA4P22748 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA4P22748 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CA4P22748 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CA4P22748 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA4P22748 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CA4P22748 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA4P22748 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA4P22748 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA4P22748 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CA4P22748 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CA4P22748 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CA4P22748 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CA4P22748 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA4P22748 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA4P22748 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CA4P22748 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA4P22748 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA4P22748 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA4P22748 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA4P22748 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA4P22748 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA4P22748 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA4P22748 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA4P22748 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA4P22748 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA4P22748 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CA4P22748 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CA4P22748 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CA4P22748 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CA4P22748 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA4P22748 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA4P22748 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA4P22748 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA4P22748 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA4P22748 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA4P22748 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms