Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms