Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00869P0C866 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00869P0C866 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms