Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4BP1O75113 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4BP1O75113 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4BP1O75113 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4BP1O75113 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
N4BP1O75113 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4BP1O75113 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4BP1O75113 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4BP1O75113 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4BP1O75113 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4BP1O75113 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
N4BP1O75113 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
N4BP1O75113 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
N4BP1O75113 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
N4BP1O75113 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
N4BP1O75113 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
N4BP1O75113 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
N4BP1O75113 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms