Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227AF5H4B4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms