Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

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Length 661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 YFL054CYFL054C 1941 nt12.93□□□□□ -0.34
RIM20Q12033 YPR064WYPR064W 420 nt12.91□□□□□ -0.34
RIM20Q12033 SNG1YGR197C 1644 nt12.91□□□□□ -0.34
RIM20Q12033 HEM12YDR047W 1089 nt12.89□□□□□ -0.35
RIM20Q12033 STB1YNL309W 1263 nt12.89□□□□□ -0.35
RIM20Q12033 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.87□□□□□ -0.35
RIM20Q12033 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.87□□□□□ -0.35
RIM20Q12033 SPC25YER018C 666 nt12.86□□□□□ -0.35
RIM20Q12033 TAD3YLR316C 969 nt12.86□□□□□ -0.35
RIM20Q12033 ANP1YEL036C 1503 nt12.83□□□□□ -0.36
RIM20Q12033 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.81□□□□□ -0.36
RIM20Q12033 CCT4YDL143W 1587 nt12.8□□□□□ -0.36
RIM20Q12033 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.79□□□□□ -0.36
RIM20Q12033 GPI16YHR188C 1833 nt12.78□□□□□ -0.36
RIM20Q12033 SPT8YLR055C 1809 nt12.78□□□□□ -0.36
RIM20Q12033 VPS60YDR486C 690 nt12.78□□□□□ -0.36
RIM20Q12033 FEN2YCR028C 1539 nt12.78□□□□□ -0.36
RIM20Q12033 ALG3YBL082C 1377 nt12.76□□□□□ -0.37
RIM20Q12033 BDH1YAL060W 1149 nt12.72□□□□□ -0.37
RIM20Q12033 SWC5YBR231C 912 nt12.7□□□□□ -0.38
RIM20Q12033 UBX6YJL048C 1191 nt12.67□□□□□ -0.38
RIM20Q12033 RAX1YOR301W 1308 nt12.66□□□□□ -0.38
RIM20Q12033 YIR016WYIR016W 798 nt12.66□□□□□ -0.38
RIM20Q12033 SWE1YJL187C 2460 nt12.65□□□□□ -0.38
RIM20Q12033 PAC11YDR488C 1602 nt12.64□□□□□ -0.39
RIM20Q12033 YDR094WYDR094W 336 nt12.63□□□□□ -0.39
RIM20Q12033 YSP3YOR003W 1437 nt12.62□□□□□ -0.39
RIM20Q12033 YLR415CYLR415C 339 nt12.61□□□□□ -0.39
RIM20Q12033 BNA2YJR078W 1362 nt12.6□□□□□ -0.39
RIM20Q12033 MIC12YBR262C 321 nt12.59□□□□□ -0.39
RIM20Q12033 YFL066CYFL066C 1179 nt12.56□□□□□ -0.4
RIM20Q12033 YFR018CYFR018C 1092 nt12.56□□□□□ -0.4
RIM20Q12033 Q0182Q0182 405 nt12.56□□□□□ -0.4
RIM20Q12033 PRE6YOL038W 765 nt12.56□□□□□ -0.4
RIM20Q12033 CCA1YER168C 1641 nt12.55□□□□□ -0.4
RIM20Q12033 YNL115CYNL115C 1935 nt12.54□□□□□ -0.4
RIM20Q12033 PEX25YPL112C 1185 nt12.53□□□□□ -0.4
RIM20Q12033 HHO1YPL127C 777 nt12.48□□□□□ -0.41
RIM20Q12033 AGP1YCL025C 1902 nt12.46□□□□□ -0.42
RIM20Q12033 XDJ1YLR090W 1380 nt12.45□□□□□ -0.42
RIM20Q12033 PAU16YKL224C 372 nt12.41□□□□□ -0.42
RIM20Q12033 SHM2YLR058C 1410 nt12.41□□□□□ -0.42
RIM20Q12033 YGR201CYGR201C 678 nt12.39□□□□□ -0.43
RIM20Q12033 GDH3YAL062W 1374 nt12.38□□□□□ -0.43
RIM20Q12033 TIM17YJL143W 477 nt12.37□□□□□ -0.43
RIM20Q12033 RRT5YFR032C 870 nt12.36□□□□□ -0.43
RIM20Q12033 DUT1YBR252W 444 nt12.36□□□□□ -0.43
RIM20Q12033 VPS75YNL246W 795 nt12.33□□□□□ -0.44
RIM20Q12033 AVT6YER119C 1347 nt12.31□□□□□ -0.44
RIM20Q12033 NIT1YIL164C 600 nt12.3□□□□□ -0.44
RIM20Q12033 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.26□□□□□ -0.45
RIM20Q12033 SGT2YOR007C 1041 nt12.26□□□□□ -0.45
RIM20Q12033 DUS1YML080W 1272 nt12.24□□□□□ -0.45
RIM20Q12033 FUR4YBR021W 1902 nt12.24□□□□□ -0.45
RIM20Q12033 GOR1YNL274C 1053 nt12.23□□□□□ -0.45
RIM20Q12033 MIR1YJR077C 936 nt12.19□□□□□ -0.46
RIM20Q12033 DAT1YML113W 747 nt12.16□□□□□ -0.46
RIM20Q12033 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.16□□□□□ -0.46
RIM20Q12033 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.16□□□□□ -0.46
RIM20Q12033 PAU7YAR020C 168 nt12.15□□□□□ -0.46
RIM20Q12033 STR3YGL184C 1398 nt12.15□□□□□ -0.46
RIM20Q12033 YCL074WYCL074W 927 nt12.14□□□□□ -0.47
RIM20Q12033 HSP60YLR259C 1719 nt12.12□□□□□ -0.47
RIM20Q12033 GLK1YCL040W 1503 nt12.11□□□□□ -0.47
RIM20Q12033 SHB17YKR043C 816 nt12.1□□□□□ -0.47
RIM20Q12033 THI74YDR438W 1113 nt12.09□□□□□ -0.47
RIM20Q12033 AQY2YLL052C 450 nt12.09□□□□□ -0.47
RIM20Q12033 YDR010CYDR010C 333 nt12.08□□□□□ -0.48
RIM20Q12033 NAT4YMR069W 858 nt12.08□□□□□ -0.48
RIM20Q12033 YCR102CYCR102C 1107 nt12.06□□□□□ -0.48
RIM20Q12033 BOR1YNL275W 1731 nt12.04□□□□□ -0.48
RIM20Q12033 MSF1YPR047W 1410 nt12.03□□□□□ -0.48
RIM20Q12033 UBA4YHR111W 1323 nt12.02□□□□□ -0.49
RIM20Q12033 NBP35YGL091C 987 nt12.01□□□□□ -0.49
RIM20Q12033 YKR005CYKR005C 1578 nt11.97□□□□□ -0.49
RIM20Q12033 PRP4YPR178W 1398 nt11.97□□□□□ -0.49
RIM20Q12033 RET2YFR051C 1641 nt11.94□□□□□ -0.5
RIM20Q12033 SHH4YLR164W 507 nt11.94□□□□□ -0.5
RIM20Q12033 YSR3YKR053C 1215 nt11.93□□□□□ -0.5
RIM20Q12033 PHO89YBR296C 1725 nt11.92□□□□□ -0.5
RIM20Q12033 NVJ2YPR091C 2313 nt11.92□□□□□ -0.5
RIM20Q12033 SFA1YDL168W 1161 nt11.91□□□□□ -0.5
RIM20Q12033 YGR259CYGR259C 441 nt11.91□□□□□ -0.5
RIM20Q12033 DPS1YLL018C 1674 nt11.9□□□□□ -0.5
RIM20Q12033 YGL034CYGL034C 366 nt11.89□□□□□ -0.51
RIM20Q12033 XYL2YLR070C 1071 nt11.89□□□□□ -0.51
RIM20Q12033 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.86□□□□□ -0.51
RIM20Q12033 TIR3YIL011W 810 nt11.86□□□□□ -0.51
RIM20Q12033 RTN2YDL204W 1182 nt11.84□□□□□ -0.51
RIM20Q12033 COQ2YNR041C 1119 nt11.81□□□□□ -0.52
RIM20Q12033 ARP6YLR085C 1317 nt11.81□□□□□ -0.52
RIM20Q12033 PLB1YMR008C 1995 nt11.8□□□□□ -0.52
RIM20Q12033 SBA1YKL117W 651 nt11.8□□□□□ -0.52
RIM20Q12033 BMT6YLR063W 1098 nt11.8□□□□□ -0.52
RIM20Q12033 PRO1YDR300C 1287 nt11.79□□□□□ -0.52
RIM20Q12033 POM34YLR018C 900 nt11.79□□□□□ -0.52
RIM20Q12033 TOM6YOR045W 186 nt11.78□□□□□ -0.52
RIM20Q12033 SNF1YDR477W 1902 nt11.76□□□□□ -0.53
RIM20Q12033 YCR087WYCR087W 516 nt11.75□□□□□ -0.53
RIM20Q12033 LSC2YGR244C 1284 nt11.75□□□□□ -0.53
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