Protein–RNA interactions for Protein: Q06344

ESF1, Pre-rRNA-processing protein ESF1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ESF1Q06344 WSC2YNL283C 1512 nt12.74□□□□□ -0.37
ESF1Q06344 YFL067WYFL067W 528 nt12.72□□□□□ -0.37
ESF1Q06344 YPR064WYPR064W 420 nt12.71□□□□□ -0.37
ESF1Q06344 DDR2YOL052C-A 186 nt12.67□□□□□ -0.38
ESF1Q06344 SPC25YER018C 666 nt12.65□□□□□ -0.38
ESF1Q06344 TAD3YLR316C 969 nt12.65□□□□□ -0.38
ESF1Q06344 STB1YNL309W 1263 nt12.64□□□□□ -0.39
ESF1Q06344 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.63□□□□□ -0.39
ESF1Q06344 HEM12YDR047W 1089 nt12.62□□□□□ -0.39
ESF1Q06344 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.62□□□□□ -0.39
ESF1Q06344 SNG1YGR197C 1644 nt12.62□□□□□ -0.39
ESF1Q06344 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.61□□□□□ -0.39
ESF1Q06344 ANP1YEL036C 1503 nt12.59□□□□□ -0.39
ESF1Q06344 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.59□□□□□ -0.39
ESF1Q06344 MIC10YCL057C-A 294 nt12.59□□□□□ -0.39
ESF1Q06344 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.58□□□□□ -0.4
ESF1Q06344 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.58□□□□□ -0.4
ESF1Q06344 GPI16YHR188C 1833 nt12.58□□□□□ -0.4
ESF1Q06344 YFL054CYFL054C 1941 nt12.56□□□□□ -0.4
ESF1Q06344 CCT4YDL143W 1587 nt12.56□□□□□ -0.4
ESF1Q06344 FEN2YCR028C 1539 nt12.52□□□□□ -0.4
ESF1Q06344 VPS60YDR486C 690 nt12.51□□□□□ -0.41
ESF1Q06344 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.51□□□□□ -0.41
ESF1Q06344 BDH1YAL060W 1149 nt12.49□□□□□ -0.41
ESF1Q06344 SPT8YLR055C 1809 nt12.48□□□□□ -0.41
ESF1Q06344 ALG3YBL082C 1377 nt12.45□□□□□ -0.42
ESF1Q06344 SWC5YBR231C 912 nt12.45□□□□□ -0.42
ESF1Q06344 YFR018CYFR018C 1092 nt12.42□□□□□ -0.42
ESF1Q06344 YIR016WYIR016W 798 nt12.41□□□□□ -0.42
ESF1Q06344 YLR415CYLR415C 339 nt12.41□□□□□ -0.42
ESF1Q06344 YSP3YOR003W 1437 nt12.41□□□□□ -0.42
ESF1Q06344 RAX1YOR301W 1308 nt12.39□□□□□ -0.43
ESF1Q06344 PAU16YKL224C 372 nt12.36□□□□□ -0.43
ESF1Q06344 MIC12YBR262C 321 nt12.36□□□□□ -0.43
ESF1Q06344 RRT5YFR032C 870 nt12.34□□□□□ -0.43
ESF1Q06344 BNA2YJR078W 1362 nt12.33□□□□□ -0.44
ESF1Q06344 PEX25YPL112C 1185 nt12.33□□□□□ -0.44
ESF1Q06344 SWE1YJL187C 2460 nt12.32□□□□□ -0.44
ESF1Q06344 YNL115CYNL115C 1935 nt12.29□□□□□ -0.44
ESF1Q06344 YFL066CYFL066C 1179 nt12.27□□□□□ -0.45
ESF1Q06344 PRE6YOL038W 765 nt12.27□□□□□ -0.45
ESF1Q06344 PAC11YDR488C 1602 nt12.22□□□□□ -0.45
ESF1Q06344 CCA1YER168C 1641 nt12.21□□□□□ -0.46
ESF1Q06344 YGR201CYGR201C 678 nt12.2□□□□□ -0.46
ESF1Q06344 NME1NME1 340 nt12.2□□□□□ -0.46
ESF1Q06344 HHO1YPL127C 777 nt12.2□□□□□ -0.46
ESF1Q06344 SBA1YKL117W 651 nt12.19□□□□□ -0.46
ESF1Q06344 XDJ1YLR090W 1380 nt12.18□□□□□ -0.46
ESF1Q06344 VPS75YNL246W 795 nt12.17□□□□□ -0.46
ESF1Q06344 TIM17YJL143W 477 nt12.16□□□□□ -0.46
ESF1Q06344 SHM2YLR058C 1410 nt12.15□□□□□ -0.46
ESF1Q06344 AGP1YCL025C 1902 nt12.13□□□□□ -0.47
ESF1Q06344 GDH3YAL062W 1374 nt12.11□□□□□ -0.47
ESF1Q06344 NIT1YIL164C 600 nt12.06□□□□□ -0.48
ESF1Q06344 NAT4YMR069W 858 nt12.02□□□□□ -0.49
ESF1Q06344 AVT6YER119C 1347 nt12.02□□□□□ -0.49
ESF1Q06344 SGT2YOR007C 1041 nt12□□□□□ -0.49
ESF1Q06344 MIR1YJR077C 936 nt11.99□□□□□ -0.49
ESF1Q06344 GOR1YNL274C 1053 nt11.98□□□□□ -0.49
ESF1Q06344 DUT1YBR252W 444 nt11.98□□□□□ -0.49
ESF1Q06344 DAT1YML113W 747 nt11.97□□□□□ -0.49
ESF1Q06344 GLK1YCL040W 1503 nt11.95□□□□□ -0.5
ESF1Q06344 PAU7YAR020C 168 nt11.92□□□□□ -0.5
ESF1Q06344 FUR4YBR021W 1902 nt11.91□□□□□ -0.5
ESF1Q06344 THI74YDR438W 1113 nt11.89□□□□□ -0.51
ESF1Q06344 DUS1YML080W 1272 nt11.89□□□□□ -0.51
ESF1Q06344 YCL074WYCL074W 927 nt11.88□□□□□ -0.51
ESF1Q06344 MSF1YPR047W 1410 nt11.86□□□□□ -0.51
ESF1Q06344 YCR102CYCR102C 1107 nt11.86□□□□□ -0.51
ESF1Q06344 YDR010CYDR010C 333 nt11.86□□□□□ -0.51
ESF1Q06344 SHB17YKR043C 816 nt11.86□□□□□ -0.51
ESF1Q06344 STR3YGL184C 1398 nt11.86□□□□□ -0.51
ESF1Q06344 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.83□□□□□ -0.51
ESF1Q06344 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.83□□□□□ -0.51
ESF1Q06344 UBA4YHR111W 1323 nt11.82□□□□□ -0.52
ESF1Q06344 HSP60YLR259C 1719 nt11.78□□□□□ -0.52
ESF1Q06344 NBP35YGL091C 987 nt11.78□□□□□ -0.52
ESF1Q06344 RET2YFR051C 1641 nt11.76□□□□□ -0.53
ESF1Q06344 AQY2YLL052C 450 nt11.75□□□□□ -0.53
ESF1Q06344 YSR3YKR053C 1215 nt11.71□□□□□ -0.53
ESF1Q06344 BOR1YNL275W 1731 nt11.7□□□□□ -0.54
ESF1Q06344 YGL034CYGL034C 366 nt11.7□□□□□ -0.54
ESF1Q06344 TIR3YIL011W 810 nt11.68□□□□□ -0.54
ESF1Q06344 PHO89YBR296C 1725 nt11.68□□□□□ -0.54
ESF1Q06344 YKR005CYKR005C 1578 nt11.67□□□□□ -0.54
ESF1Q06344 SFA1YDL168W 1161 nt11.67□□□□□ -0.54
ESF1Q06344 YMR244WYMR244W 1068 nt11.66□□□□□ -0.54
ESF1Q06344 PRP4YPR178W 1398 nt11.65□□□□□ -0.55
ESF1Q06344 XYL2YLR070C 1071 nt11.64□□□□□ -0.55
ESF1Q06344 SHH4YLR164W 507 nt11.64□□□□□ -0.55
ESF1Q06344 YCR087WYCR087W 516 nt11.63□□□□□ -0.55
ESF1Q06344 RTN2YDL204W 1182 nt11.63□□□□□ -0.55
ESF1Q06344 ARP6YLR085C 1317 nt11.62□□□□□ -0.55
ESF1Q06344 YGR259CYGR259C 441 nt11.62□□□□□ -0.55
ESF1Q06344 GLR1YPL091W 1452 nt11.6□□□□□ -0.55
ESF1Q06344 LSC2YGR244C 1284 nt11.6□□□□□ -0.55
ESF1Q06344 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.59□□□□□ -0.55
ESF1Q06344 DPS1YLL018C 1674 nt11.59□□□□□ -0.55
ESF1Q06344 COQ2YNR041C 1119 nt11.58□□□□□ -0.56
ESF1Q06344 POM34YLR018C 900 nt11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.5 ms