Protein–RNA interactions for Protein: Q04062

RPN9, 26S proteasome regulatory subunit RPN9, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN9Q04062 ATF2YGR177C 1608 nt11.03□□□□□ -0.64
RPN9Q04062 YFL067WYFL067W 528 nt11.03□□□□□ -0.64
RPN9Q04062 TRM5YHR070W 1500 nt11.01□□□□□ -0.65
RPN9Q04062 AHT1YHR093W 549 nt11.01□□□□□ -0.65
RPN9Q04062 WSC2YNL283C 1512 nt11□□□□□ -0.65
RPN9Q04062 YPR064WYPR064W 420 nt10.99□□□□□ -0.65
RPN9Q04062 DDR2YOL052C-A 186 nt10.96□□□□□ -0.65
RPN9Q04062 SPC25YER018C 666 nt10.95□□□□□ -0.66
RPN9Q04062 HEM12YDR047W 1089 nt10.94□□□□□ -0.66
RPN9Q04062 STB1YNL309W 1263 nt10.94□□□□□ -0.66
RPN9Q04062 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.93□□□□□ -0.66
RPN9Q04062 TAD3YLR316C 969 nt10.93□□□□□ -0.66
RPN9Q04062 SNG1YGR197C 1644 nt10.93□□□□□ -0.66
RPN9Q04062 YFL054CYFL054C 1941 nt10.92□□□□□ -0.66
RPN9Q04062 ANP1YEL036C 1503 nt10.9□□□□□ -0.66
RPN9Q04062 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.9□□□□□ -0.66
RPN9Q04062 MIC10YCL057C-A 294 nt10.9□□□□□ -0.66
RPN9Q04062 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.89□□□□□ -0.67
RPN9Q04062 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.88□□□□□ -0.67
RPN9Q04062 GPI16YHR188C 1833 nt10.88□□□□□ -0.67
RPN9Q04062 CCT4YDL143W 1587 nt10.86□□□□□ -0.67
RPN9Q04062 SPT8YLR055C 1809 nt10.84□□□□□ -0.67
RPN9Q04062 FEN2YCR028C 1539 nt10.83□□□□□ -0.68
RPN9Q04062 VPS60YDR486C 690 nt10.82□□□□□ -0.68
RPN9Q04062 BDH1YAL060W 1149 nt10.78□□□□□ -0.68
RPN9Q04062 RAX1YOR301W 1308 nt10.77□□□□□ -0.69
RPN9Q04062 ALG3YBL082C 1377 nt10.77□□□□□ -0.69
RPN9Q04062 SWC5YBR231C 912 nt10.76□□□□□ -0.69
RPN9Q04062 YDR094WYDR094W 336 nt10.74□□□□□ -0.69
RPN9Q04062 YIR016WYIR016W 798 nt10.74□□□□□ -0.69
RPN9Q04062 MIC12YBR262C 321 nt10.73□□□□□ -0.69
RPN9Q04062 YLR415CYLR415C 339 nt10.72□□□□□ -0.69
RPN9Q04062 SWE1YJL187C 2460 nt10.71□□□□□ -0.69
RPN9Q04062 YSP3YOR003W 1437 nt10.71□□□□□ -0.69
RPN9Q04062 BNA2YJR078W 1362 nt10.7□□□□□ -0.7
RPN9Q04062 YFR018CYFR018C 1092 nt10.7□□□□□ -0.7
RPN9Q04062 UBX6YJL048C 1191 nt10.66□□□□□ -0.7
RPN9Q04062 PEX25YPL112C 1185 nt10.65□□□□□ -0.7
RPN9Q04062 YNL115CYNL115C 1935 nt10.6□□□□□ -0.71
RPN9Q04062 CCA1YER168C 1641 nt10.59□□□□□ -0.71
RPN9Q04062 YGR201CYGR201C 678 nt10.59□□□□□ -0.71
RPN9Q04062 PRE6YOL038W 765 nt10.56□□□□□ -0.72
RPN9Q04062 YFL066CYFL066C 1179 nt10.55□□□□□ -0.72
RPN9Q04062 HHO1YPL127C 777 nt10.55□□□□□ -0.72
RPN9Q04062 XDJ1YLR090W 1380 nt10.54□□□□□ -0.72
RPN9Q04062 RRT5YFR032C 870 nt10.53□□□□□ -0.72
RPN9Q04062 TIM17YJL143W 477 nt10.52□□□□□ -0.73
RPN9Q04062 VPS75YNL246W 795 nt10.52□□□□□ -0.73
RPN9Q04062 MCH5YOR306C 1566 nt10.52□□□□□ -0.73
RPN9Q04062 AGP1YCL025C 1902 nt10.5□□□□□ -0.73
RPN9Q04062 SHM2YLR058C 1410 nt10.5□□□□□ -0.73
RPN9Q04062 BOR1YNL275W 1731 nt10.5□□□□□ -0.73
RPN9Q04062 PAU16YKL224C 372 nt10.49□□□□□ -0.73
RPN9Q04062 GDH3YAL062W 1374 nt10.46□□□□□ -0.74
RPN9Q04062 NIT1YIL164C 600 nt10.43□□□□□ -0.74
RPN9Q04062 AVT6YER119C 1347 nt10.39□□□□□ -0.75
RPN9Q04062 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.39□□□□□ -0.75
RPN9Q04062 DAT1YML113W 747 nt10.39□□□□□ -0.75
RPN9Q04062 GOR1YNL274C 1053 nt10.38□□□□□ -0.75
RPN9Q04062 SGT2YOR007C 1041 nt10.37□□□□□ -0.75
RPN9Q04062 FUR4YBR021W 1902 nt10.35□□□□□ -0.75
RPN9Q04062 DUT1YBR252W 444 nt10.35□□□□□ -0.75
RPN9Q04062 MIR1YJR077C 936 nt10.34□□□□□ -0.75
RPN9Q04062 YCL074WYCL074W 927 nt10.32□□□□□ -0.76
RPN9Q04062 DUS1YML080W 1272 nt10.31□□□□□ -0.76
RPN9Q04062 PAU7YAR020C 168 nt10.29□□□□□ -0.76
RPN9Q04062 STR3YGL184C 1398 nt10.27□□□□□ -0.76
RPN9Q04062 YCR102CYCR102C 1107 nt10.27□□□□□ -0.77
RPN9Q04062 GLK1YCL040W 1503 nt10.27□□□□□ -0.77
RPN9Q04062 NAT4YMR069W 858 nt10.26□□□□□ -0.77
RPN9Q04062 HSP60YLR259C 1719 nt10.26□□□□□ -0.77
RPN9Q04062 THI74YDR438W 1113 nt10.25□□□□□ -0.77
RPN9Q04062 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.25□□□□□ -0.77
RPN9Q04062 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.25□□□□□ -0.77
RPN9Q04062 YDR010CYDR010C 333 nt10.23□□□□□ -0.77
RPN9Q04062 SHB17YKR043C 816 nt10.23□□□□□ -0.77
RPN9Q04062 MSF1YPR047W 1410 nt10.22□□□□□ -0.77
RPN9Q04062 NBP35YGL091C 987 nt10.2□□□□□ -0.78
RPN9Q04062 UBA4YHR111W 1323 nt10.19□□□□□ -0.78
RPN9Q04062 ALG12YNR030W 1656 nt10.18□□□□□ -0.78
RPN9Q04062 AQY2YLL052C 450 nt10.17□□□□□ -0.78
RPN9Q04062 RET2YFR051C 1641 nt10.17□□□□□ -0.78
RPN9Q04062 YKR005CYKR005C 1578 nt10.15□□□□□ -0.78
RPN9Q04062 PRP4YPR178W 1398 nt10.14□□□□□ -0.79
RPN9Q04062 RTN2YDL204W 1182 nt10.12□□□□□ -0.79
RPN9Q04062 TIR3YIL011W 810 nt10.12□□□□□ -0.79
RPN9Q04062 YGR259CYGR259C 441 nt10.1□□□□□ -0.79
RPN9Q04062 YSR3YKR053C 1215 nt10.1□□□□□ -0.79
RPN9Q04062 ARP6YLR085C 1317 nt10.08□□□□□ -0.8
RPN9Q04062 PHO89YBR296C 1725 nt10.07□□□□□ -0.8
RPN9Q04062 DPS1YLL018C 1674 nt10.07□□□□□ -0.8
RPN9Q04062 YCR087WYCR087W 516 nt10.07□□□□□ -0.8
RPN9Q04062 SFA1YDL168W 1161 nt10.07□□□□□ -0.8
RPN9Q04062 YGL034CYGL034C 366 nt10.07□□□□□ -0.8
RPN9Q04062 LSC2YGR244C 1284 nt10.07□□□□□ -0.8
RPN9Q04062 BMT6YLR063W 1098 nt10.05□□□□□ -0.8
RPN9Q04062 SHH4YLR164W 507 nt10.05□□□□□ -0.8
RPN9Q04062 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.02□□□□□ -0.81
RPN9Q04062 POM34YLR018C 900 nt10.01□□□□□ -0.81
RPN9Q04062 XYL2YLR070C 1071 nt10.01□□□□□ -0.81
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