Protein–RNA interactions for Protein: Q03280

TOM1, E3 ubiquitin-protein ligase TOM1, yeastyeast

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Length 3,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOM1Q03280 SPT8YLR055C 1809 nt12.35□□□□□ -0.43
TOM1Q03280 YLR415CYLR415C 339 nt12.35□□□□□ -0.43
TOM1Q03280 YSC84YHR016C 1407 nt12.34□□□□□ -0.43
TOM1Q03280 AIM45YPR004C 1035 nt12.31□□□□□ -0.44
TOM1Q03280 GAL1YBR020W 1587 nt12.31□□□□□ -0.44
TOM1Q03280 YIH1YCR059C 777 nt12.3□□□□□ -0.44
TOM1Q03280 IRC15YPL017C 1500 nt12.28□□□□□ -0.44
TOM1Q03280 GIS3YLR094C 1509 nt12.26□□□□□ -0.45
TOM1Q03280 CAB5YDR196C 726 nt12.24□□□□□ -0.45
TOM1Q03280 ESS1YJR017C 513 nt12.24□□□□□ -0.45
TOM1Q03280 PAU7YAR020C 168 nt12.24□□□□□ -0.45
TOM1Q03280 SWC5YBR231C 912 nt12.21□□□□□ -0.45
TOM1Q03280 CCT4YDL143W 1587 nt12.21□□□□□ -0.45
TOM1Q03280 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt12.21□□□□□ -0.46
TOM1Q03280 YLL053CYLL053C 459 nt12.2□□□□□ -0.46
TOM1Q03280 SEN2YLR105C 1134 nt12.2□□□□□ -0.46
TOM1Q03280 YMR226CYMR226C 804 nt12.2□□□□□ -0.46
TOM1Q03280 SHB17YKR043C 816 nt12.19□□□□□ -0.46
TOM1Q03280 PUP1YOR157C 786 nt12.19□□□□□ -0.46
TOM1Q03280 ATF2YGR177C 1608 nt12.17□□□□□ -0.46
TOM1Q03280 YLR279WYLR279W 390 nt12.16□□□□□ -0.46
TOM1Q03280 TRM5YHR070W 1500 nt12.16□□□□□ -0.46
TOM1Q03280 YJR114WYJR114W 393 nt12.15□□□□□ -0.46
TOM1Q03280 STB1YNL309W 1263 nt12.14□□□□□ -0.47
TOM1Q03280 RET2YFR051C 1641 nt12.13□□□□□ -0.47
TOM1Q03280 YDR010CYDR010C 333 nt12.12□□□□□ -0.47
TOM1Q03280 YLR111WYLR111W 333 nt12.12□□□□□ -0.47
TOM1Q03280 AQY1YPR192W 918 nt12.12□□□□□ -0.47
TOM1Q03280 CUE1YMR264W 612 nt12.12□□□□□ -0.47
TOM1Q03280 SGT2YOR007C 1041 nt12.1□□□□□ -0.47
TOM1Q03280 YCR087WYCR087W 516 nt12.08□□□□□ -0.47
TOM1Q03280 VPS60YDR486C 690 nt12.08□□□□□ -0.47
TOM1Q03280 BIO4YNR057C 714 nt12.08□□□□□ -0.47
TOM1Q03280 GPN2YOR262W 1044 nt12.08□□□□□ -0.48
TOM1Q03280 FUN14YAL008W 597 nt12.08□□□□□ -0.48
TOM1Q03280 FTR1YER145C 1215 nt12.07□□□□□ -0.48
TOM1Q03280 SPC25YER018C 666 nt12.06□□□□□ -0.48
TOM1Q03280 YSR3YKR053C 1215 nt12.05□□□□□ -0.48
TOM1Q03280 EMI2YDR516C 1503 nt12.04□□□□□ -0.48
TOM1Q03280 YIL100WYIL100W 354 nt12.03□□□□□ -0.48
TOM1Q03280 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.01□□□□□ -0.49
TOM1Q03280 TIM17YJL143W 477 nt12.01□□□□□ -0.49
TOM1Q03280 SHM2YLR058C 1410 nt12□□□□□ -0.49
TOM1Q03280 GPI16YHR188C 1833 nt11.97□□□□□ -0.49
TOM1Q03280 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.93□□□□□ -0.5
TOM1Q03280 PHO89YBR296C 1725 nt11.92□□□□□ -0.5
TOM1Q03280 SCC4YER147C 1875 nt11.91□□□□□ -0.5
TOM1Q03280 BMT6YLR063W 1098 nt11.91□□□□□ -0.5
TOM1Q03280 LYS4YDR234W 2082 nt11.91□□□□□ -0.5
TOM1Q03280 YJL195CYJL195C 702 nt11.89□□□□□ -0.51
TOM1Q03280 COQ2YNR041C 1119 nt11.84□□□□□ -0.51
TOM1Q03280 ERG6YML008C 1152 nt11.84□□□□□ -0.51
TOM1Q03280 RRT12YCR045C 1476 nt11.81□□□□□ -0.52
TOM1Q03280 FEN2YCR028C 1539 nt11.81□□□□□ -0.52
TOM1Q03280 ANP1YEL036C 1503 nt11.81□□□□□ -0.52
TOM1Q03280 DDR2YOL052C-A 186 nt11.78□□□□□ -0.52
TOM1Q03280 ADH1YOL086C 1047 nt11.78□□□□□ -0.52
TOM1Q03280 YHL050CYHL050C 2094 nt11.78□□□□□ -0.52
TOM1Q03280 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.77□□□□□ -0.52
TOM1Q03280 SDH5YOL071W 489 nt11.77□□□□□ -0.53
TOM1Q03280 RAD23YEL037C 1197 nt11.77□□□□□ -0.53
TOM1Q03280 SLG1YOR008C 1137 nt11.76□□□□□ -0.53
TOM1Q03280 SIM1YIL123W 1431 nt11.75□□□□□ -0.53
TOM1Q03280 SDH1YKL148C 1923 nt11.75□□□□□ -0.53
TOM1Q03280 YDL221WYDL221W 552 nt11.75□□□□□ -0.53
TOM1Q03280 RPL4BYDR012W 1089 nt11.75□□□□□ -0.53
TOM1Q03280 RPL4AYBR031W 1089 nt11.75□□□□□ -0.53
TOM1Q03280 NAP1YKR048C 1254 nt11.75□□□□□ -0.53
TOM1Q03280 MRP20YDR405W 792 nt11.74□□□□□ -0.53
TOM1Q03280 SNG1YGR197C 1644 nt11.74□□□□□ -0.53
TOM1Q03280 SFA1YDL168W 1161 nt11.72□□□□□ -0.53
TOM1Q03280 YEL008WYEL008W 381 nt11.68□□□□□ -0.54
TOM1Q03280 YFL067WYFL067W 528 nt11.68□□□□□ -0.54
TOM1Q03280 NCP1YHR042W 2076 nt11.64□□□□□ -0.55
TOM1Q03280 CRR1YLR213C 1269 nt11.63□□□□□ -0.55
TOM1Q03280 RIB3YDR487C 627 nt11.62□□□□□ -0.55
TOM1Q03280 CPD1YGR247W 720 nt11.62□□□□□ -0.55
TOM1Q03280 PAU5YFL020C 369 nt11.59□□□□□ -0.55
TOM1Q03280 XDJ1YLR090W 1380 nt11.58□□□□□ -0.55
TOM1Q03280 RIB1YBL033C 1038 nt11.58□□□□□ -0.56
TOM1Q03280 YGR012WYGR012W 1182 nt11.58□□□□□ -0.56
TOM1Q03280 RPS14BYJL191W 417 nt11.58□□□□□ -0.56
TOM1Q03280 YJL064WYJL064W 396 nt11.55□□□□□ -0.56
TOM1Q03280 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.55□□□□□ -0.56
TOM1Q03280 NIT1YIL164C 600 nt11.53□□□□□ -0.56
TOM1Q03280 HIP1YGR191W 1812 nt11.52□□□□□ -0.57
TOM1Q03280 PGC1YPL206C 966 nt11.52□□□□□ -0.57
TOM1Q03280 MIC10YCL057C-A 294 nt11.51□□□□□ -0.57
TOM1Q03280 TIM44YIL022W 1296 nt11.5□□□□□ -0.57
TOM1Q03280 MSB4YOL112W 1479 nt11.5□□□□□ -0.57
TOM1Q03280 RIB2YOL066C 1776 nt11.49□□□□□ -0.57
TOM1Q03280 STP3YLR375W 1032 nt11.45□□□□□ -0.58
TOM1Q03280 AAC1YMR056C 930 nt11.45□□□□□ -0.58
TOM1Q03280 YBR232CYBR232C 360 nt11.45□□□□□ -0.58
TOM1Q03280 YIR016WYIR016W 798 nt11.44□□□□□ -0.58
TOM1Q03280 POP2YNR052C 1302 nt11.43□□□□□ -0.58
TOM1Q03280 BUD20YLR074C 501 nt11.43□□□□□ -0.58
TOM1Q03280 YMR090WYMR090W 684 nt11.42□□□□□ -0.58
TOM1Q03280 TSC10YBR265W 963 nt11.42□□□□□ -0.58
TOM1Q03280 PEX2YJL210W 816 nt11.41□□□□□ -0.58
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