Protein–RNA interactions for Protein: P53289

RTS3, Protein phosphatase type 2A regulatory subunit RTS3, yeastyeast

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTS3P53289 YIH1YCR059C 777 nt10.72□□□□□ -0.69
RTS3P53289 TIM23YNR017W 669 nt10.71□□□□□ -0.69
RTS3P53289 BIO4YNR057C 714 nt10.71□□□□□ -0.69
RTS3P53289 RNQ1YCL028W 1218 nt10.71□□□□□ -0.69
RTS3P53289 ILV2YMR108W 2064 nt10.7□□□□□ -0.7
RTS3P53289 DIC1YLR348C 897 nt10.69□□□□□ -0.7
RTS3P53289 YLR179CYLR179C 606 nt10.68□□□□□ -0.7
RTS3P53289 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.66□□□□□ -0.7
RTS3P53289 YPR064WYPR064W 420 nt10.65□□□□□ -0.7
RTS3P53289 YJL225CYJL225C 5277 nt10.64□□□□□ -0.71
RTS3P53289 LYS4YDR234W 2082 nt10.63□□□□□ -0.71
RTS3P53289 YJR154WYJR154W 1041 nt10.63□□□□□ -0.71
RTS3P53289 YLL053CYLL053C 459 nt10.63□□□□□ -0.71
RTS3P53289 RFC1YOR217W 2586 nt10.63□□□□□ -0.71
RTS3P53289 PUS7YOR243C 2031 nt10.62□□□□□ -0.71
RTS3P53289 RRT5YFR032C 870 nt10.6□□□□□ -0.71
RTS3P53289 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.56□□□□□ -0.72
RTS3P53289 FTR1YER145C 1215 nt10.55□□□□□ -0.72
RTS3P53289 ERF2YLR246W 1080 nt10.55□□□□□ -0.72
RTS3P53289 NPP1YCR026C 2229 nt10.54□□□□□ -0.72
RTS3P53289 TAD3YLR316C 969 nt10.53□□□□□ -0.72
RTS3P53289 ATF2YGR177C 1608 nt10.51□□□□□ -0.73
RTS3P53289 YFR018CYFR018C 1092 nt10.51□□□□□ -0.73
RTS3P53289 CRR1YLR213C 1269 nt10.51□□□□□ -0.73
RTS3P53289 GAL1YBR020W 1587 nt10.51□□□□□ -0.73
RTS3P53289 PAU16YKL224C 372 nt10.5□□□□□ -0.73
RTS3P53289 GNP1YDR508C 1992 nt10.49□□□□□ -0.73
RTS3P53289 YFL054CYFL054C 1941 nt10.48□□□□□ -0.73
RTS3P53289 TRM5YHR070W 1500 nt10.48□□□□□ -0.73
RTS3P53289 YFL067WYFL067W 528 nt10.47□□□□□ -0.73
RTS3P53289 MCH5YOR306C 1566 nt10.46□□□□□ -0.74
RTS3P53289 AQY1YPR192W 918 nt10.45□□□□□ -0.74
RTS3P53289 AHT1YHR093W 549 nt10.44□□□□□ -0.74
RTS3P53289 DDR2YOL052C-A 186 nt10.43□□□□□ -0.74
RTS3P53289 WSC2YNL283C 1512 nt10.42□□□□□ -0.74
RTS3P53289 XDJ1YLR090W 1380 nt10.41□□□□□ -0.74
RTS3P53289 HEM12YDR047W 1089 nt10.41□□□□□ -0.74
RTS3P53289 MIC10YCL057C-A 294 nt10.41□□□□□ -0.74
RTS3P53289 SPT8YLR055C 1809 nt10.41□□□□□ -0.74
RTS3P53289 SNG1YGR197C 1644 nt10.4□□□□□ -0.74
RTS3P53289 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.4□□□□□ -0.74
RTS3P53289 MET2YNL277W 1461 nt10.4□□□□□ -0.74
RTS3P53289 YNL115CYNL115C 1935 nt10.39□□□□□ -0.75
RTS3P53289 SPC25YER018C 666 nt10.39□□□□□ -0.75
RTS3P53289 NME1NME1 340 nt10.39□□□□□ -0.75
RTS3P53289 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.38□□□□□ -0.75
RTS3P53289 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.38□□□□□ -0.75
RTS3P53289 STB1YNL309W 1263 nt10.38□□□□□ -0.75
RTS3P53289 PRE6YOL038W 765 nt10.38□□□□□ -0.75
RTS3P53289 YAT1YAR035W 2064 nt10.38□□□□□ -0.75
RTS3P53289 ANP1YEL036C 1503 nt10.37□□□□□ -0.75
RTS3P53289 YLR415CYLR415C 339 nt10.35□□□□□ -0.75
RTS3P53289 SFP1YLR403W 2052 nt10.34□□□□□ -0.75
RTS3P53289 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.34□□□□□ -0.75
RTS3P53289 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.34□□□□□ -0.75
RTS3P53289 NAT4YMR069W 858 nt10.34□□□□□ -0.75
RTS3P53289 GLK1YCL040W 1503 nt10.33□□□□□ -0.76
RTS3P53289 YFL066CYFL066C 1179 nt10.33□□□□□ -0.76
RTS3P53289 PEX25YPL112C 1185 nt10.32□□□□□ -0.76
RTS3P53289 SWC5YBR231C 912 nt10.32□□□□□ -0.76
RTS3P53289 GAL2YLR081W 1725 nt10.31□□□□□ -0.76
RTS3P53289 FEN2YCR028C 1539 nt10.31□□□□□ -0.76
RTS3P53289 CCT4YDL143W 1587 nt10.31□□□□□ -0.76
RTS3P53289 GPI16YHR188C 1833 nt10.3□□□□□ -0.76
RTS3P53289 VPS60YDR486C 690 nt10.27□□□□□ -0.77
RTS3P53289 SBA1YKL117W 651 nt10.27□□□□□ -0.77
RTS3P53289 RAX1YOR301W 1308 nt10.27□□□□□ -0.77
RTS3P53289 SWE1YJL187C 2460 nt10.27□□□□□ -0.77
RTS3P53289 YIR016WYIR016W 798 nt10.24□□□□□ -0.77
RTS3P53289 BDH1YAL060W 1149 nt10.24□□□□□ -0.77
RTS3P53289 ALG3YBL082C 1377 nt10.23□□□□□ -0.77
RTS3P53289 YSP3YOR003W 1437 nt10.23□□□□□ -0.77
RTS3P53289 TOK1YJL093C 2076 nt10.21□□□□□ -0.78
RTS3P53289 GTB1YDR221W 2109 nt10.21□□□□□ -0.78
RTS3P53289 PAU7YAR020C 168 nt10.2□□□□□ -0.78
RTS3P53289 MIC12YBR262C 321 nt10.2□□□□□ -0.78
RTS3P53289 BNA2YJR078W 1362 nt10.16□□□□□ -0.78
RTS3P53289 FRA1YLL029W 2250 nt10.16□□□□□ -0.78
RTS3P53289 VPS75YNL246W 795 nt10.15□□□□□ -0.78
RTS3P53289 MSF1YPR047W 1410 nt10.15□□□□□ -0.79
RTS3P53289 THI74YDR438W 1113 nt10.14□□□□□ -0.79
RTS3P53289 YMR244WYMR244W 1068 nt10.14□□□□□ -0.79
RTS3P53289 CCA1YER168C 1641 nt10.13□□□□□ -0.79
RTS3P53289 TIM17YJL143W 477 nt10.1□□□□□ -0.79
RTS3P53289 HHO1YPL127C 777 nt10.08□□□□□ -0.8
RTS3P53289 MET8YBR213W 825 nt10.07□□□□□ -0.8
RTS3P53289 MIR1YJR077C 936 nt10.06□□□□□ -0.8
RTS3P53289 AGP1YCL025C 1902 nt10.04□□□□□ -0.8
RTS3P53289 NAS6YGR232W 687 nt10.03□□□□□ -0.8
RTS3P53289 YGR201CYGR201C 678 nt10.02□□□□□ -0.81
RTS3P53289 CLB6YGR109C 1143 nt10.01□□□□□ -0.81
RTS3P53289 DAT1YML113W 747 nt9.99□□□□□ -0.81
RTS3P53289 GDH3YAL062W 1374 nt9.98□□□□□ -0.81
RTS3P53289 SHM2YLR058C 1410 nt9.97□□□□□ -0.81
RTS3P53289 HXT10YFL011W 1641 nt9.96□□□□□ -0.82
RTS3P53289 YSR3YKR053C 1215 nt9.95□□□□□ -0.82
RTS3P53289 HEL2YDR266C 1920 nt9.95□□□□□ -0.82
RTS3P53289 BOR1YNL275W 1731 nt9.94□□□□□ -0.82
RTS3P53289 UBA4YHR111W 1323 nt9.94□□□□□ -0.82
RTS3P53289 YGL034CYGL034C 366 nt9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.9 ms