Protein–RNA interactions for Protein: P53122

YGL138C, Uncharacterized protein YGL138C, yeastyeast

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YGL138CP53122 DDR2YOL052C-A 186 nt12.37□□□□□ -0.43
YGL138CP53122 PTK1YKL198C 1989 nt12.37□□□□□ -0.43
YGL138CP53122 YFL067WYFL067W 528 nt12.35□□□□□ -0.43
YGL138CP53122 STB1YNL309W 1263 nt12.34□□□□□ -0.43
YGL138CP53122 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.32□□□□□ -0.44
YGL138CP53122 MIC10YCL057C-A 294 nt12.32□□□□□ -0.44
YGL138CP53122 YDR094WYDR094W 336 nt12.3□□□□□ -0.44
YGL138CP53122 SPC25YER018C 666 nt12.3□□□□□ -0.44
YGL138CP53122 SNG1YGR197C 1644 nt12.29□□□□□ -0.44
YGL138CP53122 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.29□□□□□ -0.44
YGL138CP53122 HEM12YDR047W 1089 nt12.29□□□□□ -0.44
YGL138CP53122 CCT4YDL143W 1587 nt12.26□□□□□ -0.45
YGL138CP53122 GPI16YHR188C 1833 nt12.25□□□□□ -0.45
YGL138CP53122 VPS60YDR486C 690 nt12.24□□□□□ -0.45
YGL138CP53122 ANP1YEL036C 1503 nt12.22□□□□□ -0.45
YGL138CP53122 FEN2YCR028C 1539 nt12.21□□□□□ -0.45
YGL138CP53122 YFL054CYFL054C 1941 nt12.21□□□□□ -0.46
YGL138CP53122 BDH1YAL060W 1149 nt12.2□□□□□ -0.46
YGL138CP53122 SWC5YBR231C 912 nt12.2□□□□□ -0.46
YGL138CP53122 ALG3YBL082C 1377 nt12.18□□□□□ -0.46
YGL138CP53122 PRE6YOL038W 765 nt12.16□□□□□ -0.46
YGL138CP53122 YFR018CYFR018C 1092 nt12.15□□□□□ -0.46
YGL138CP53122 YLR415CYLR415C 339 nt12.15□□□□□ -0.46
YGL138CP53122 YFL066CYFL066C 1179 nt12.13□□□□□ -0.47
YGL138CP53122 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.13□□□□□ -0.47
YGL138CP53122 YSP3YOR003W 1437 nt12.12□□□□□ -0.47
YGL138CP53122 YIR016WYIR016W 798 nt12.11□□□□□ -0.47
YGL138CP53122 PEX25YPL112C 1185 nt12.08□□□□□ -0.48
YGL138CP53122 YNL115CYNL115C 1935 nt12.07□□□□□ -0.48
YGL138CP53122 PAU16YKL224C 372 nt12.07□□□□□ -0.48
YGL138CP53122 BNA2YJR078W 1362 nt12.05□□□□□ -0.48
YGL138CP53122 RAX1YOR301W 1308 nt12.04□□□□□ -0.48
YGL138CP53122 SPT8YLR055C 1809 nt12.03□□□□□ -0.48
YGL138CP53122 RRT5YFR032C 870 nt12.03□□□□□ -0.48
YGL138CP53122 Q0182Q0182 405 nt12□□□□□ -0.49
YGL138CP53122 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.97□□□□□ -0.49
YGL138CP53122 MIC12YBR262C 321 nt11.97□□□□□ -0.49
YGL138CP53122 SWE1YJL187C 2460 nt11.92□□□□□ -0.5
YGL138CP53122 XDJ1YLR090W 1380 nt11.92□□□□□ -0.5
YGL138CP53122 HHO1YPL127C 777 nt11.9□□□□□ -0.5
YGL138CP53122 TIM17YJL143W 477 nt11.89□□□□□ -0.51
YGL138CP53122 SHM2YLR058C 1410 nt11.88□□□□□ -0.51
YGL138CP53122 CCA1YER168C 1641 nt11.88□□□□□ -0.51
YGL138CP53122 VPS75YNL246W 795 nt11.87□□□□□ -0.51
YGL138CP53122 GDH3YAL062W 1374 nt11.84□□□□□ -0.51
YGL138CP53122 YGR201CYGR201C 678 nt11.81□□□□□ -0.52
YGL138CP53122 AGP1YCL025C 1902 nt11.8□□□□□ -0.52
YGL138CP53122 AVT6YER119C 1347 nt11.78□□□□□ -0.52
YGL138CP53122 GLK1YCL040W 1503 nt11.77□□□□□ -0.52
YGL138CP53122 NIT1YIL164C 600 nt11.77□□□□□ -0.53
YGL138CP53122 MIR1YJR077C 936 nt11.77□□□□□ -0.53
YGL138CP53122 SGT2YOR007C 1041 nt11.77□□□□□ -0.53
YGL138CP53122 PAU7YAR020C 168 nt11.76□□□□□ -0.53
YGL138CP53122 NAT4YMR069W 858 nt11.75□□□□□ -0.53
YGL138CP53122 DUT1YBR252W 444 nt11.75□□□□□ -0.53
YGL138CP53122 PAC11YDR488C 1602 nt11.71□□□□□ -0.53
YGL138CP53122 THI74YDR438W 1113 nt11.71□□□□□ -0.53
YGL138CP53122 GOR1YNL274C 1053 nt11.7□□□□□ -0.54
YGL138CP53122 DUS1YML080W 1272 nt11.67□□□□□ -0.54
YGL138CP53122 MSF1YPR047W 1410 nt11.67□□□□□ -0.54
YGL138CP53122 SHB17YKR043C 816 nt11.65□□□□□ -0.54
YGL138CP53122 DAT1YML113W 747 nt11.62□□□□□ -0.55
YGL138CP53122 UBA4YHR111W 1323 nt11.6□□□□□ -0.55
YGL138CP53122 YDR010CYDR010C 333 nt11.6□□□□□ -0.55
YGL138CP53122 SBA1YKL117W 651 nt11.58□□□□□ -0.56
YGL138CP53122 YCR102CYCR102C 1107 nt11.54□□□□□ -0.56
YGL138CP53122 YSR3YKR053C 1215 nt11.54□□□□□ -0.56
YGL138CP53122 FUR4YBR021W 1902 nt11.53□□□□□ -0.56
YGL138CP53122 AQY2YLL052C 450 nt11.53□□□□□ -0.56
YGL138CP53122 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.52□□□□□ -0.57
YGL138CP53122 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.52□□□□□ -0.57
YGL138CP53122 YCL074WYCL074W 927 nt11.52□□□□□ -0.57
YGL138CP53122 STR3YGL184C 1398 nt11.52□□□□□ -0.57
YGL138CP53122 YGL034CYGL034C 366 nt11.51□□□□□ -0.57
YGL138CP53122 PHO89YBR296C 1725 nt11.5□□□□□ -0.57
YGL138CP53122 XYL2YLR070C 1071 nt11.49□□□□□ -0.57
YGL138CP53122 RET2YFR051C 1641 nt11.49□□□□□ -0.57
YGL138CP53122 NBP35YGL091C 987 nt11.45□□□□□ -0.58
YGL138CP53122 SFA1YDL168W 1161 nt11.41□□□□□ -0.58
YGL138CP53122 SHH4YLR164W 507 nt11.41□□□□□ -0.58
YGL138CP53122 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.39□□□□□ -0.59
YGL138CP53122 RBG1YAL036C 1110 nt11.39□□□□□ -0.59
YGL138CP53122 HSP60YLR259C 1719 nt11.36□□□□□ -0.59
YGL138CP53122 YCR087WYCR087W 516 nt11.36□□□□□ -0.59
YGL138CP53122 COQ2YNR041C 1119 nt11.36□□□□□ -0.59
YGL138CP53122 MRP20YDR405W 792 nt11.34□□□□□ -0.59
YGL138CP53122 TIR3YIL011W 810 nt11.34□□□□□ -0.59
YGL138CP53122 NDI1YML120C 1542 nt11.34□□□□□ -0.59
YGL138CP53122 AIM45YPR004C 1035 nt11.33□□□□□ -0.6
YGL138CP53122 YKR005CYKR005C 1578 nt11.29□□□□□ -0.6
YGL138CP53122 TOM6YOR045W 186 nt11.29□□□□□ -0.6
YGL138CP53122 PRP4YPR178W 1398 nt11.27□□□□□ -0.61
YGL138CP53122 PRO1YDR300C 1287 nt11.26□□□□□ -0.61
YGL138CP53122 YGR259CYGR259C 441 nt11.26□□□□□ -0.61
YGL138CP53122 BOR1YNL275W 1731 nt11.26□□□□□ -0.61
YGL138CP53122 POM34YLR018C 900 nt11.25□□□□□ -0.61
YGL138CP53122 GLR1YPL091W 1452 nt11.25□□□□□ -0.61
YGL138CP53122 RTN2YDL204W 1182 nt11.24□□□□□ -0.61
YGL138CP53122 PEX2YJL210W 816 nt11.23□□□□□ -0.61
YGL138CP53122 ARP6YLR085C 1317 nt11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.8 ms