Protein–RNA interactions for Protein: P53078

SDT1, Suppressor of disruption of TFIIS, yeastyeast

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SDT1P53078 TRM5YHR070W 1500 nt10.48□□□□□ -0.73
SDT1P53078 DDR2YOL052C-A 186 nt10.46□□□□□ -0.73
SDT1P53078 ATF2YGR177C 1608 nt10.46□□□□□ -0.74
SDT1P53078 AHT1YHR093W 549 nt10.45□□□□□ -0.74
SDT1P53078 WSC2YNL283C 1512 nt10.43□□□□□ -0.74
SDT1P53078 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.42□□□□□ -0.74
SDT1P53078 HEM12YDR047W 1089 nt10.41□□□□□ -0.74
SDT1P53078 TAD3YLR316C 969 nt10.41□□□□□ -0.74
SDT1P53078 STB1YNL309W 1263 nt10.41□□□□□ -0.74
SDT1P53078 SPC25YER018C 666 nt10.4□□□□□ -0.74
SDT1P53078 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.39□□□□□ -0.75
SDT1P53078 GPI16YHR188C 1833 nt10.38□□□□□ -0.75
SDT1P53078 SNG1YGR197C 1644 nt10.37□□□□□ -0.75
SDT1P53078 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.37□□□□□ -0.75
SDT1P53078 YFL054CYFL054C 1941 nt10.36□□□□□ -0.75
SDT1P53078 ANP1YEL036C 1503 nt10.34□□□□□ -0.75
SDT1P53078 MIC10YCL057C-A 294 nt10.33□□□□□ -0.76
SDT1P53078 CCT4YDL143W 1587 nt10.33□□□□□ -0.76
SDT1P53078 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.31□□□□□ -0.76
SDT1P53078 FEN2YCR028C 1539 nt10.3□□□□□ -0.76
SDT1P53078 VPS60YDR486C 690 nt10.29□□□□□ -0.76
SDT1P53078 SWC5YBR231C 912 nt10.29□□□□□ -0.76
SDT1P53078 SPT8YLR055C 1809 nt10.26□□□□□ -0.77
SDT1P53078 YDR094WYDR094W 336 nt10.25□□□□□ -0.77
SDT1P53078 YLR415CYLR415C 339 nt10.24□□□□□ -0.77
SDT1P53078 RAX1YOR301W 1308 nt10.24□□□□□ -0.77
SDT1P53078 BNA2YJR078W 1362 nt10.24□□□□□ -0.77
SDT1P53078 BDH1YAL060W 1149 nt10.22□□□□□ -0.77
SDT1P53078 ALG3YBL082C 1377 nt10.21□□□□□ -0.78
SDT1P53078 YIR016WYIR016W 798 nt10.2□□□□□ -0.78
SDT1P53078 YFR018CYFR018C 1092 nt10.19□□□□□ -0.78
SDT1P53078 UBX6YJL048C 1191 nt10.17□□□□□ -0.78
SDT1P53078 BOR1YNL275W 1731 nt10.16□□□□□ -0.78
SDT1P53078 MIC12YBR262C 321 nt10.16□□□□□ -0.78
SDT1P53078 YSP3YOR003W 1437 nt10.16□□□□□ -0.78
SDT1P53078 PEX25YPL112C 1185 nt10.15□□□□□ -0.78
SDT1P53078 SWE1YJL187C 2460 nt10.12□□□□□ -0.79
SDT1P53078 YNL115CYNL115C 1935 nt10.09□□□□□ -0.79
SDT1P53078 RRT5YFR032C 870 nt10.09□□□□□ -0.79
SDT1P53078 YGR201CYGR201C 678 nt10.08□□□□□ -0.8
SDT1P53078 HHO1YPL127C 777 nt10.07□□□□□ -0.8
SDT1P53078 TIM17YJL143W 477 nt10.06□□□□□ -0.8
SDT1P53078 XDJ1YLR090W 1380 nt10.04□□□□□ -0.8
SDT1P53078 YFL066CYFL066C 1179 nt10.04□□□□□ -0.8
SDT1P53078 CCA1YER168C 1641 nt10.04□□□□□ -0.8
SDT1P53078 VPS75YNL246W 795 nt10.03□□□□□ -0.8
SDT1P53078 PRE6YOL038W 765 nt10.03□□□□□ -0.8
SDT1P53078 UME6YDR207C 2511 nt10.01□□□□□ -0.81
SDT1P53078 PAU16YKL224C 372 nt10□□□□□ -0.81
SDT1P53078 SHM2YLR058C 1410 nt9.99□□□□□ -0.81
SDT1P53078 GDH3YAL062W 1374 nt9.97□□□□□ -0.81
SDT1P53078 AGP1YCL025C 1902 nt9.92□□□□□ -0.82
SDT1P53078 AVT6YER119C 1347 nt9.92□□□□□ -0.82
SDT1P53078 GOR1YNL274C 1053 nt9.92□□□□□ -0.82
SDT1P53078 HSP60YLR259C 1719 nt9.9□□□□□ -0.83
SDT1P53078 PAU7YAR020C 168 nt9.89□□□□□ -0.83
SDT1P53078 DUS1YML080W 1272 nt9.88□□□□□ -0.83
SDT1P53078 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.87□□□□□ -0.83
SDT1P53078 NIT1YIL164C 600 nt9.87□□□□□ -0.83
SDT1P53078 DAT1YML113W 747 nt9.87□□□□□ -0.83
SDT1P53078 SGT2YOR007C 1041 nt9.87□□□□□ -0.83
SDT1P53078 GLK1YCL040W 1503 nt9.87□□□□□ -0.83
SDT1P53078 MIR1YJR077C 936 nt9.84□□□□□ -0.83
SDT1P53078 NAT4YMR069W 858 nt9.84□□□□□ -0.83
SDT1P53078 YCL074WYCL074W 927 nt9.81□□□□□ -0.84
SDT1P53078 THI74YDR438W 1113 nt9.8□□□□□ -0.84
SDT1P53078 FUR4YBR021W 1902 nt9.8□□□□□ -0.84
SDT1P53078 YCR102CYCR102C 1107 nt9.79□□□□□ -0.84
SDT1P53078 DUT1YBR252W 444 nt9.79□□□□□ -0.84
SDT1P53078 ALG12YNR030W 1656 nt9.79□□□□□ -0.84
SDT1P53078 MCH5YOR306C 1566 nt9.79□□□□□ -0.84
SDT1P53078 MSF1YPR047W 1410 nt9.75□□□□□ -0.85
SDT1P53078 SHB17YKR043C 816 nt9.75□□□□□ -0.85
SDT1P53078 STR3YGL184C 1398 nt9.74□□□□□ -0.85
SDT1P53078 UBA4YHR111W 1323 nt9.72□□□□□ -0.85
SDT1P53078 YDR010CYDR010C 333 nt9.7□□□□□ -0.86
SDT1P53078 AQY2YLL052C 450 nt9.7□□□□□ -0.86
SDT1P53078 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.69□□□□□ -0.86
SDT1P53078 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.69□□□□□ -0.86
SDT1P53078 RET2YFR051C 1641 nt9.68□□□□□ -0.86
SDT1P53078 YSR3YKR053C 1215 nt9.67□□□□□ -0.86
SDT1P53078 YCR087WYCR087W 516 nt9.66□□□□□ -0.86
SDT1P53078 NBP35YGL091C 987 nt9.66□□□□□ -0.86
SDT1P53078 PHO89YBR296C 1725 nt9.63□□□□□ -0.87
SDT1P53078 RTN2YDL204W 1182 nt9.63□□□□□ -0.87
SDT1P53078 TIR3YIL011W 810 nt9.62□□□□□ -0.87
SDT1P53078 YKR005CYKR005C 1578 nt9.62□□□□□ -0.87
SDT1P53078 PRP4YPR178W 1398 nt9.62□□□□□ -0.87
SDT1P53078 YGL034CYGL034C 366 nt9.61□□□□□ -0.87
SDT1P53078 BMT6YLR063W 1098 nt9.6□□□□□ -0.87
SDT1P53078 YGR259CYGR259C 441 nt9.59□□□□□ -0.87
SDT1P53078 LSC2YGR244C 1284 nt9.58□□□□□ -0.88
SDT1P53078 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.56□□□□□ -0.88
SDT1P53078 SFA1YDL168W 1161 nt9.55□□□□□ -0.88
SDT1P53078 MRP20YDR405W 792 nt9.55□□□□□ -0.88
SDT1P53078 XYL2YLR070C 1071 nt9.55□□□□□ -0.88
SDT1P53078 AAC1YMR056C 930 nt9.55□□□□□ -0.88
SDT1P53078 ARP6YLR085C 1317 nt9.55□□□□□ -0.88
SDT1P53078 AIM45YPR004C 1035 nt9.54□□□□□ -0.88
SDT1P53078 DPS1YLL018C 1674 nt9.54□□□□□ -0.88
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