Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 MOK-240ENST00000562292 735 ntTSL 511.5□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 DLEU1-229ENST00000486895 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 DLEU1-209ENST00000468522 1158 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.583e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 MOK-235ENST00000557823 635 ntTSL 311.33□□□□□ -0.63e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 SART3-201ENST00000228284 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 DLEU1-234ENST00000491615 1451 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.73e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 XPNPEP1-204ENST00000403138 1006 ntTSL 210.46□□□□□ -0.733e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 DLEU1-206ENST00000463474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 XPNPEP1-210ENST00000460523 817 ntTSL 210.14□□□□□ -0.793e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 XPNPEP1-226ENST00000509646 404 ntTSL 39.85□□□□□ -0.833e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 DLEU1-225ENST00000484529 400 ntTSL 1 (best)9.72□□□□□ -0.853e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 DLEU1-228ENST00000485007 736 ntTSL 59.55□□□□□ -0.883e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 CEP68-205ENST00000537589 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.883e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.913e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 XPNPEP1-214ENST00000490740 821 ntTSL 59.3□□□□□ -0.923e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 SART3-204ENST00000546728 3637 ntTSL 1 (best)9.23□□□□□ -0.933e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 AP001347.1-201ENST00000428809 1332 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -13e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 STN1-203ENST00000466828 1414 ntTSL 58.79□□□□□ -13e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 AP001347.1-202ENST00000432621 1084 ntTSL 1 (best)8.63□□□□□ -1.033e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 MOK-231ENST00000524120 546 ntTSL 38.62□□□□□ -1.033e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.033e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 SART3-209ENST00000548077 625 ntTSL 28.4□□□□□ -1.063e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.133e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 MOK-217ENST00000521388 770 ntTSL 57.86□□□□□ -1.153e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 ANKFY1-205ENST00000572412 3352 ntTSL 27.81□□□□□ -1.163e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.163e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 XPNPEP1-208ENST00000451592 587 ntTSL 37.78□□□□□ -1.163e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 XPNPEP1-207ENST00000443078 770 ntTSL 57.52□□□□□ -1.213e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 XPNPEP1-206ENST00000430337 922 ntTSL 37.27□□□□□ -1.253e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 XPNPEP1-221ENST00000506777 822 ntTSL 56.49□□□□□ -1.373e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 SART3-205ENST00000546808 405 ntTSL 56.09□□□□□ -1.433e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 LINC00894-204ENST00000444489 2951 ntTSL 512.55□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 81.4
AARSP49588 LINC00894-205ENST00000449111 3414 ntTSL 510.23□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 81.4
AARSP49588 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.321e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 PTDSS2-203ENST00000525727 837 ntTSL 1 (best)22.98■■□□□ 1.271e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 PTDSS2-207ENST00000527479 520 ntTSL 522.47■■□□□ 1.191e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.171e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 FHOD1-202ENST00000561922 2069 ntTSL 222.3■■□□□ 1.161e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.861e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 PTDSS2-212ENST00000531520 890 ntTSL 320.38■□□□□ 0.851e-8■■■■■ 78.6
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AARSP49588 EHMT1-223ENST00000629808 689 ntTSL 517.29■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 FHOD1-207ENST00000567752 4321 ntTSL 216.13■□□□□ 0.171e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 EHMT1-252ENST00000640639 1259 ntTSL 515.53■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 EHMT1-251ENST00000638071 1710 ntTSL 515.4■□□□□ 0.061e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 PTDSS2-213ENST00000532614 437 ntTSL 314.46□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 EHMT1-218ENST00000495657 649 ntTSL 514.26□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 PFAS-205ENST00000580356 4242 ntTSL 214.04□□□□□ -0.161e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.231e-8■■■■■ 78.6
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AARSP49588 FHOD1-208ENST00000568595 520 ntTSL 411.72□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 78.6
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AARSP49588 EHMT1-205ENST00000462942 7842 ntTSL 211.09□□□□□ -0.631e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 TGFBR1-209ENST00000552516 5933 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.641e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 510.91□□□□□ -0.661e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.821e-8■■■■■ 78.6
AARSP49588 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 74.9
AARSP49588 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)20.7■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 74.9
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AARSP49588 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.434e-6■■■■■ 72.6
AARSP49588 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.66■■□□□ 1.064e-6■■■■■ 72.6
AARSP49588 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.944e-6■■■■■ 72.6
AARSP49588 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.814e-6■■■■■ 72.6
AARSP49588 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 519.57■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 72.6
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AARSP49588 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.213e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.143e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.13e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.13e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 PQLC1-214ENST00000593030 764 ntTSL 527.73■■■□□ 2.033e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 PQLC1-213ENST00000591964 856 ntTSL 327.59■■■□□ 2.013e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.513e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.53e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.413e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.43e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.233e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 VOPP1-210ENST00000453112 552 ntTSL 422.7■■□□□ 1.223e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 LRP8-209ENST00000480045 3231 ntTSL 522.65■■□□□ 1.223e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.23e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 REXO1-205ENST00000587524 1390 ntTSL 1 (best)22.42■■□□□ 1.183e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 MAP2K2-208ENST00000599345 923 ntTSL 522.29■■□□□ 1.163e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.143e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 KIAA0368-206ENST00000602978 539 ntAPPRIS ALT2 TSL 422.15■■□□□ 1.143e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 PQLC1-206ENST00000474967 2319 ntTSL 522.04■■□□□ 1.123e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 TOLLIP-210ENST00000530506 1297 ntTSL 521.87■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 PRDM11-202ENST00000526442 762 ntTSL 321.85■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 FLOT1-202ENST00000413165 856 ntTSL 521.83■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.073e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 VOPP1-209ENST00000452832 485 ntTSL 221.67■■□□□ 1.063e-7■■■■■ 72.1
AARSP49588 CEP350-210ENST00000491495 1059 ntTSL 521.6■■□□□ 1.053e-7■■■■■ 72.1
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