Protein–RNA interactions for Protein: P47976

CTH1, mRNA decay factor CTH1, yeastyeast

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTH1P47976 YGL034CYGL034C 366 nt13.6□□□□□ -0.23
CTH1P47976 RPM1RPM1 483 nt13.57□□□□□ -0.24
CTH1P47976 RAD51YER095W 1203 nt13.56□□□□□ -0.24
CTH1P47976 VPS75YNL246W 795 nt13.56□□□□□ -0.24
CTH1P47976 SCC4YER147C 1875 nt13.56□□□□□ -0.24
CTH1P47976 YLL053CYLL053C 459 nt13.55□□□□□ -0.24
CTH1P47976 NDI1YML120C 1542 nt13.54□□□□□ -0.24
CTH1P47976 AQY1YPR192W 918 nt13.5□□□□□ -0.25
CTH1P47976 FTR1YER145C 1215 nt13.49□□□□□ -0.25
CTH1P47976 GAL1YBR020W 1587 nt13.49□□□□□ -0.25
CTH1P47976 CCT4YDL143W 1587 nt13.46□□□□□ -0.25
CTH1P47976 RBG1YAL036C 1110 nt13.46□□□□□ -0.25
CTH1P47976 SAM1YLR180W 1149 nt13.46□□□□□ -0.25
CTH1P47976 UBA4YHR111W 1323 nt13.45□□□□□ -0.26
CTH1P47976 TRM5YHR070W 1500 nt13.44□□□□□ -0.26
CTH1P47976 STB1YNL309W 1263 nt13.43□□□□□ -0.26
CTH1P47976 PAU7YAR020C 168 nt13.42□□□□□ -0.26
CTH1P47976 PCH2YBR186W 1695 nt13.41□□□□□ -0.26
CTH1P47976 XYL2YLR070C 1071 nt13.41□□□□□ -0.26
CTH1P47976 SPC25YER018C 666 nt13.39□□□□□ -0.27
CTH1P47976 BIO4YNR057C 714 nt13.39□□□□□ -0.27
CTH1P47976 YSR3YKR053C 1215 nt13.38□□□□□ -0.27
CTH1P47976 SWC5YBR231C 912 nt13.37□□□□□ -0.27
CTH1P47976 GUT2YIL155C 1950 nt13.37□□□□□ -0.27
CTH1P47976 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.36□□□□□ -0.27
CTH1P47976 VPS60YDR486C 690 nt13.35□□□□□ -0.27
CTH1P47976 SEC11YIR022W 504 nt13.35□□□□□ -0.27
CTH1P47976 SHB17YKR043C 816 nt13.35□□□□□ -0.27
CTH1P47976 ALG3YBL082C 1377 nt13.34□□□□□ -0.27
CTH1P47976 SPT8YLR055C 1809 nt13.33□□□□□ -0.28
CTH1P47976 YMR226CYMR226C 804 nt13.31□□□□□ -0.28
CTH1P47976 GPI16YHR188C 1833 nt13.3□□□□□ -0.28
CTH1P47976 YNR029CYNR029C 1290 nt13.28□□□□□ -0.28
CTH1P47976 YHL050CYHL050C 2094 nt13.26□□□□□ -0.29
CTH1P47976 SIM1YIL123W 1431 nt13.25□□□□□ -0.29
CTH1P47976 DDR2YOL052C-A 186 nt13.23□□□□□ -0.29
CTH1P47976 ATF2YGR177C 1608 nt13.22□□□□□ -0.29
CTH1P47976 PIB2YGL023C 1908 nt13.22□□□□□ -0.29
CTH1P47976 PAC11YDR488C 1602 nt13.21□□□□□ -0.29
CTH1P47976 YDR010CYDR010C 333 nt13.2□□□□□ -0.3
CTH1P47976 RRT12YCR045C 1476 nt13.19□□□□□ -0.3
CTH1P47976 FEN2YCR028C 1539 nt13.17□□□□□ -0.3
CTH1P47976 YNL195CYNL195C 786 nt13.13□□□□□ -0.31
CTH1P47976 AIM45YPR004C 1035 nt13.13□□□□□ -0.31
CTH1P47976 PHO89YBR296C 1725 nt13.13□□□□□ -0.31
CTH1P47976 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt13.12□□□□□ -0.31
CTH1P47976 TIM17YJL143W 477 nt13.12□□□□□ -0.31
CTH1P47976 YLR349WYLR349W 507 nt13.12□□□□□ -0.31
CTH1P47976 STE4YOR212W 1272 nt13.11□□□□□ -0.31
CTH1P47976 YFL067WYFL067W 528 nt13.1□□□□□ -0.31
CTH1P47976 YCR087WYCR087W 516 nt13.06□□□□□ -0.32
CTH1P47976 YLR111WYLR111W 333 nt13.06□□□□□ -0.32
CTH1P47976 ANP1YEL036C 1503 nt13.06□□□□□ -0.32
CTH1P47976 RTF1YGL244W 1677 nt13.05□□□□□ -0.32
CTH1P47976 RET2YFR051C 1641 nt13.05□□□□□ -0.32
CTH1P47976 ADH7YCR105W 1086 nt13.04□□□□□ -0.32
CTH1P47976 YIR016WYIR016W 798 nt13.03□□□□□ -0.32
CTH1P47976 SHM2YLR058C 1410 nt13.03□□□□□ -0.32
CTH1P47976 PAU15YIR041W 375 nt13.02□□□□□ -0.33
CTH1P47976 ERF2YLR246W 1080 nt13.01□□□□□ -0.33
CTH1P47976 SGT2YOR007C 1041 nt12.99□□□□□ -0.33
CTH1P47976 CRR1YLR213C 1269 nt12.96□□□□□ -0.33
CTH1P47976 YLR279WYLR279W 390 nt12.94□□□□□ -0.34
CTH1P47976 BOP3YNL042W 1191 nt12.94□□□□□ -0.34
CTH1P47976 SNG1YGR197C 1644 nt12.93□□□□□ -0.34
CTH1P47976 NIT1YIL164C 600 nt12.93□□□□□ -0.34
CTH1P47976 COQ2YNR041C 1119 nt12.93□□□□□ -0.34
CTH1P47976 MRP20YDR405W 792 nt12.92□□□□□ -0.34
CTH1P47976 PTK1YKL198C 1989 nt12.91□□□□□ -0.34
CTH1P47976 MIC10YCL057C-A 294 nt12.89□□□□□ -0.35
CTH1P47976 XDJ1YLR090W 1380 nt12.88□□□□□ -0.35
CTH1P47976 NCP1YHR042W 2076 nt12.87□□□□□ -0.35
CTH1P47976 CAB5YDR196C 726 nt12.86□□□□□ -0.35
CTH1P47976 FUN14YAL008W 597 nt12.86□□□□□ -0.35
CTH1P47976 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.84□□□□□ -0.35
CTH1P47976 HEM12YDR047W 1089 nt12.83□□□□□ -0.36
CTH1P47976 SDH5YOL071W 489 nt12.82□□□□□ -0.36
CTH1P47976 GPN2YOR262W 1044 nt12.79□□□□□ -0.36
CTH1P47976 YJL195CYJL195C 702 nt12.78□□□□□ -0.36
CTH1P47976 SFA1YDL168W 1161 nt12.75□□□□□ -0.37
CTH1P47976 GDH3YAL062W 1374 nt12.75□□□□□ -0.37
CTH1P47976 RAD23YEL037C 1197 nt12.73□□□□□ -0.37
CTH1P47976 ESS1YJR017C 513 nt12.71□□□□□ -0.37
CTH1P47976 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt12.69□□□□□ -0.38
CTH1P47976 NVJ2YPR091C 2313 nt12.69□□□□□ -0.38
CTH1P47976 RPL4BYDR012W 1089 nt12.68□□□□□ -0.38
CTH1P47976 RPL4AYBR031W 1089 nt12.68□□□□□ -0.38
CTH1P47976 RPS14BYJL191W 417 nt12.66□□□□□ -0.38
CTH1P47976 LYS4YDR234W 2082 nt12.65□□□□□ -0.38
CTH1P47976 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.65□□□□□ -0.38
CTH1P47976 PUP1YOR157C 786 nt12.64□□□□□ -0.39
CTH1P47976 ADH1YOL086C 1047 nt12.62□□□□□ -0.39
CTH1P47976 RIB3YDR487C 627 nt12.61□□□□□ -0.39
CTH1P47976 YFL054CYFL054C 1941 nt12.6□□□□□ -0.39
CTH1P47976 CPD1YGR247W 720 nt12.6□□□□□ -0.39
CTH1P47976 YGR012WYGR012W 1182 nt12.58□□□□□ -0.4
CTH1P47976 BNA2YJR078W 1362 nt12.56□□□□□ -0.4
CTH1P47976 CLB6YGR109C 1143 nt12.55□□□□□ -0.4
CTH1P47976 SEN2YLR105C 1134 nt12.55□□□□□ -0.4
CTH1P47976 MIC12YBR262C 321 nt12.55□□□□□ -0.4
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