Protein–RNA interactions for Protein: P38137

PCS60, Peroxisomal-coenzyme A synthetase, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PCS60P38137 YNL115CYNL115C 1935 nt12.62□□□□□ -0.39
PCS60P38137 THI74YDR438W 1113 nt12.62□□□□□ -0.39 RIP-Chip
PCS60P38137 VAR1Q0140 1197 nt12.62□□□□□ -0.39
PCS60P38137 SEM1YDR363W-A 270 nt12.61□□□□□ -0.39
PCS60P38137 Q0144Q0144 330 nt12.61□□□□□ -0.39
PCS60P38137 YSP3YOR003W 1437 nt12.6□□□□□ -0.39 RIP-Chip
PCS60P38137 GLR1YPL091W 1452 nt12.59□□□□□ -0.39
PCS60P38137 EMI2YDR516C 1503 nt12.57□□□□□ -0.4
PCS60P38137 GIS3YLR094C 1509 nt12.57□□□□□ -0.4
PCS60P38137 YIH1YCR059C 777 nt12.56□□□□□ -0.4
PCS60P38137 MIR1YJR077C 936 nt12.56□□□□□ -0.4
PCS60P38137 BDH1YAL060W 1149 nt12.56□□□□□ -0.4
PCS60P38137 ABZ2YMR289W 1125 nt12.55□□□□□ -0.4
PCS60P38137 YDL221WYDL221W 552 nt12.54□□□□□ -0.4
PCS60P38137 YLR415CYLR415C 339 nt12.52□□□□□ -0.41
PCS60P38137 RBG2YGR173W 1107 nt12.49□□□□□ -0.41
PCS60P38137 YSC84YHR016C 1407 nt12.47□□□□□ -0.41 RIP-Chip
PCS60P38137 AQY1YPR192W 918 nt12.46□□□□□ -0.41
PCS60P38137 TOM20YGR082W 552 nt12.45□□□□□ -0.42
PCS60P38137 DAT1YML113W 747 nt12.43□□□□□ -0.42
PCS60P38137 YMR090WYMR090W 684 nt12.43□□□□□ -0.42
PCS60P38137 YLL053CYLL053C 459 nt12.42□□□□□ -0.42
PCS60P38137 VPS75YNL246W 795 nt12.42□□□□□ -0.42
PCS60P38137 ARP10YDR106W 855 nt12.4□□□□□ -0.42
PCS60P38137 SSA4YER103W 1929 nt12.39□□□□□ -0.43
PCS60P38137 FTR1YER145C 1215 nt12.38□□□□□ -0.43
PCS60P38137 YGL034CYGL034C 366 nt12.37□□□□□ -0.43
PCS60P38137 GAL1YBR020W 1587 nt12.36□□□□□ -0.43
PCS60P38137 LCP5YER127W 1074 nt12.36□□□□□ -0.43
PCS60P38137 CCT4YDL143W 1587 nt12.34□□□□□ -0.43
PCS60P38137 NDI1YML120C 1542 nt12.32□□□□□ -0.44
PCS60P38137 URH1YDR400W 1023 nt12.32□□□□□ -0.44
PCS60P38137 STB1YNL309W 1263 nt12.32□□□□□ -0.44
PCS60P38137 PAU7YAR020C 168 nt12.31□□□□□ -0.44 RIP-Chip
PCS60P38137 SPC25YER018C 666 nt12.3□□□□□ -0.44
PCS60P38137 TRM5YHR070W 1500 nt12.3□□□□□ -0.44
PCS60P38137 SCC4YER147C 1875 nt12.29□□□□□ -0.44
PCS60P38137 BIO4YNR057C 714 nt12.27□□□□□ -0.45 RIP-Chip
PCS60P38137 SWC5YBR231C 912 nt12.27□□□□□ -0.45
PCS60P38137 UBA4YHR111W 1323 nt12.26□□□□□ -0.45
PCS60P38137 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.25□□□□□ -0.45
PCS60P38137 GPI16YHR188C 1833 nt12.25□□□□□ -0.45 RIP-Chip
PCS60P38137 UTP6YDR449C 1323 nt12.23□□□□□ -0.45
PCS60P38137 RBG1YAL036C 1110 nt12.23□□□□□ -0.45
PCS60P38137 SDH1YKL148C 1923 nt12.23□□□□□ -0.45
PCS60P38137 AI5_BETAQ0075 1065 nt12.22□□□□□ -0.45
PCS60P38137 VPS60YDR486C 690 nt12.22□□□□□ -0.45
PCS60P38137 SPT8YLR055C 1809 nt12.22□□□□□ -0.45 RIP-Chip
PCS60P38137 YSR3YKR053C 1215 nt12.21□□□□□ -0.45
PCS60P38137 SAM1YLR180W 1149 nt12.21□□□□□ -0.45
PCS60P38137 YNL195CYNL195C 786 nt12.21□□□□□ -0.45
PCS60P38137 YBR220CYBR220C 1683 nt12.2□□□□□ -0.46
PCS60P38137 SIM1YIL123W 1431 nt12.2□□□□□ -0.46
PCS60P38137 YMR226CYMR226C 804 nt12.19□□□□□ -0.46 RIP-Chip
PCS60P38137 DDR2YOL052C-A 186 nt12.19□□□□□ -0.46
PCS60P38137 YCR099CYCR099C 468 nt12.18□□□□□ -0.46 RIP-Chip
PCS60P38137 RPM1RPM1 483 nt12.18□□□□□ -0.46
PCS60P38137 XYL2YLR070C 1071 nt12.17□□□□□ -0.46 RIP-Chip
PCS60P38137 SHB17YKR043C 816 nt12.15□□□□□ -0.46
PCS60P38137 ALG3YBL082C 1377 nt12.15□□□□□ -0.46
PCS60P38137 HMT1YBR034C 1047 nt12.14□□□□□ -0.47
PCS60P38137 ATF2YGR177C 1608 nt12.11□□□□□ -0.47
PCS60P38137 YFL067WYFL067W 528 nt12.1□□□□□ -0.47
PCS60P38137 PET20YPL159C 762 nt12.1□□□□□ -0.47
PCS60P38137 RAD51YER095W 1203 nt12.09□□□□□ -0.47 RIP-Chip
PCS60P38137 FEN2YCR028C 1539 nt12.09□□□□□ -0.47 RIP-Chip
PCS60P38137 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.07□□□□□ -0.48
PCS60P38137 AI3Q0060 1248 nt12.06□□□□□ -0.48
PCS60P38137 TIM17YJL143W 477 nt12.06□□□□□ -0.48
PCS60P38137 SKG1YKR100C 1068 nt12.05□□□□□ -0.48
PCS60P38137 RRT12YCR045C 1476 nt12.04□□□□□ -0.48
PCS60P38137 YPL071CYPL071C 471 nt12.03□□□□□ -0.48
PCS60P38137 YCR087WYCR087W 516 nt12.02□□□□□ -0.49
PCS60P38137 snR78snR78 87 nt12.01□□□□□ -0.49
PCS60P38137 YJL118WYJL118W 660 nt12.01□□□□□ -0.49
PCS60P38137 ERF2YLR246W 1080 nt12.01□□□□□ -0.49
PCS60P38137 YDR010CYDR010C 333 nt12□□□□□ -0.49
PCS60P38137 ANP1YEL036C 1503 nt12□□□□□ -0.49
PCS60P38137 AIM45YPR004C 1035 nt11.99□□□□□ -0.49
PCS60P38137 PHO89YBR296C 1725 nt11.97□□□□□ -0.49 RIP-Chip
PCS60P38137 YIR016WYIR016W 798 nt11.96□□□□□ -0.49
PCS60P38137 BDF1YLR399C 2061 nt11.95□□□□□ -0.5
PCS60P38137 YLR111WYLR111W 333 nt11.94□□□□□ -0.5
PCS60P38137 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.94□□□□□ -0.5
PCS60P38137 YNR029CYNR029C 1290 nt11.94□□□□□ -0.5
PCS60P38137 RET2YFR051C 1641 nt11.93□□□□□ -0.5
PCS60P38137 YHM2YMR241W 945 nt11.93□□□□□ -0.5
PCS60P38137 SHM2YLR058C 1410 nt11.93□□□□□ -0.5
PCS60P38137 CRR1YLR213C 1269 nt11.92□□□□□ -0.5
PCS60P38137 SNG1YGR197C 1644 nt11.87□□□□□ -0.51 RIP-Chip
PCS60P38137 STE4YOR212W 1272 nt11.87□□□□□ -0.51
PCS60P38137 MRP20YDR405W 792 nt11.86□□□□□ -0.51
PCS60P38137 SGT2YOR007C 1041 nt11.86□□□□□ -0.51
PCS60P38137 YHL050CYHL050C 2094 nt11.85□□□□□ -0.51
PCS60P38137 YNR068CYNR068C 819 nt11.84□□□□□ -0.51
PCS60P38137 HEM12YDR047W 1089 nt11.82□□□□□ -0.52 RIP-Chip
PCS60P38137 YLR349WYLR349W 507 nt11.82□□□□□ -0.52
PCS60P38137 NIT1YIL164C 600 nt11.81□□□□□ -0.52
PCS60P38137 XDJ1YLR090W 1380 nt11.8□□□□□ -0.52
PCS60P38137 TAT1YBR069C 1860 nt11.79□□□□□ -0.52
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