Protein–RNA interactions for Protein: P25441

RPC53, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, yeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC53	P25441	WSC2	YNL283C	1512 nt		12.02	□□□□□ -0.48
RPC53	P25441	GAL1	YBR020W	1587 nt		12.02	□□□□□ -0.49
RPC53	P25441	ATF2	YGR177C	1608 nt		12.02	□□□□□ -0.49
RPC53	P25441	AHT1	YHR093W	549 nt		12.02	□□□□□ -0.49
RPC53	P25441	TRM5	YHR070W	1500 nt		12.01	□□□□□ -0.49
RPC53	P25441	TAD3	YLR316C	969 nt		12	□□□□□ -0.49
RPC53	P25441	YFL067W	YFL067W	528 nt		11.99	□□□□□ -0.49
RPC53	P25441	HEM12	YDR047W	1089 nt		11.95	□□□□□ -0.5
RPC53	P25441	DDR2	YOL052C-A	186 nt		11.95	□□□□□ -0.5
RPC53	P25441	SPT8	YLR055C	1809 nt		11.94	□□□□□ -0.5
RPC53	P25441	MIC10	YCL057C-A	294 nt		11.92	□□□□□ -0.5
RPC53	P25441	SNG1	YGR197C	1644 nt		11.91	□□□□□ -0.5
RPC53	P25441	STB1	YNL309W	1263 nt		11.91	□□□□□ -0.5
RPC53	P25441	SPC25	YER018C	666 nt		11.89	□□□□□ -0.51
RPC53	P25441	YDL086C-A	YDL086C-A	435 nt		11.88	□□□□□ -0.51
RPC53	P25441	YDR524C-B	YDR524C-B	201 nt		11.88	□□□□□ -0.51
RPC53	P25441	GPI16	YHR188C	1833 nt		11.88	□□□□□ -0.51
RPC53	P25441	YFR018C	YFR018C	1092 nt		11.87	□□□□□ -0.51
RPC53	P25441	YHR056W-A	YHR056W-A	435 nt		11.85	□□□□□ -0.51
RPC53	P25441	CCT4	YDL143W	1587 nt		11.84	□□□□□ -0.51
RPC53	P25441	ANP1	YEL036C	1503 nt		11.83	□□□□□ -0.52
RPC53	P25441	YJL225C	YJL225C	5277 nt		11.83	□□□□□ -0.52
RPC53	P25441	SWC5	YBR231C	912 nt		11.81	□□□□□ -0.52
RPC53	P25441	YLR415C	YLR415C	339 nt		11.8	□□□□□ -0.52
RPC53	P25441	VPS60	YDR486C	690 nt		11.79	□□□□□ -0.52
RPC53	P25441	RRT5	YFR032C	870 nt		11.79	□□□□□ -0.52
RPC53	P25441	BDH1	YAL060W	1149 nt		11.79	□□□□□ -0.52
RPC53	P25441	FEN2	YCR028C	1539 nt		11.78	□□□□□ -0.52
RPC53	P25441	SWE1	YJL187C	2460 nt		11.78	□□□□□ -0.52
RPC53	P25441	RAX1	YOR301W	1308 nt		11.77	□□□□□ -0.53
RPC53	P25441	PEX25	YPL112C	1185 nt		11.76	□□□□□ -0.53
RPC53	P25441	PAU16	YKL224C	372 nt		11.74	□□□□□ -0.53
RPC53	P25441	YSP3	YOR003W	1437 nt		11.74	□□□□□ -0.53
RPC53	P25441	PRE6	YOL038W	765 nt		11.73	□□□□□ -0.53
RPC53	P25441	YFL015W-A	YFL015W-A	318 nt		11.72	□□□□□ -0.53
RPC53	P25441	BNA2	YJR078W	1362 nt		11.7	□□□□□ -0.54
RPC53	P25441	ALG3	YBL082C	1377 nt		11.7	□□□□□ -0.54
RPC53	P25441	YNL115C	YNL115C	1935 nt		11.69	□□□□□ -0.54
RPC53	P25441	YIR016W	YIR016W	798 nt		11.68	□□□□□ -0.54
RPC53	P25441	YFL066C	YFL066C	1179 nt		11.67	□□□□□ -0.54
RPC53	P25441	MIC12	YBR262C	321 nt		11.65	□□□□□ -0.54
RPC53	P25441	CCA1	YER168C	1641 nt		11.63	□□□□□ -0.55
RPC53	P25441	VPS75	YNL246W	795 nt		11.58	□□□□□ -0.56
RPC53	P25441	HHO1	YPL127C	777 nt		11.56	□□□□□ -0.56
RPC53	P25441	TIM17	YJL143W	477 nt		11.55	□□□□□ -0.56
RPC53	P25441	NAT4	YMR069W	858 nt		11.5	□□□□□ -0.57
RPC53	P25441	GLK1	YCL040W	1503 nt		11.5	□□□□□ -0.57
RPC53	P25441	YGR201C	YGR201C	678 nt		11.49	□□□□□ -0.57
RPC53	P25441	XDJ1	YLR090W	1380 nt		11.49	□□□□□ -0.57
RPC53	P25441	AGP1	YCL025C	1902 nt		11.48	□□□□□ -0.57
RPC53	P25441	SHM2	YLR058C	1410 nt		11.45	□□□□□ -0.58
RPC53	P25441	MIR1	YJR077C	936 nt		11.44	□□□□□ -0.58
RPC53	P25441	PAU7	YAR020C	168 nt		11.43	□□□□□ -0.58
RPC53	P25441	FUR4	YBR021W	1902 nt		11.42	□□□□□ -0.58
RPC53	P25441	RDN37-1	RDN37-1	5354 nt		11.42	□□□□□ -0.58
RPC53	P25441	RDN37-2	RDN37-2	5354 nt		11.42	□□□□□ -0.58
RPC53	P25441	GDH3	YAL062W	1374 nt		11.41	□□□□□ -0.58
RPC53	P25441	THI74	YDR438W	1113 nt		11.4	□□□□□ -0.58
RPC53	P25441	DUS1	YML080W	1272 nt		11.39	□□□□□ -0.59
RPC53	P25441	MSF1	YPR047W	1410 nt		11.39	□□□□□ -0.59
RPC53	P25441	BOR1	YNL275W	1731 nt		11.38	□□□□□ -0.59
RPC53	P25441	AVT6	YER119C	1347 nt		11.37	□□□□□ -0.59
RPC53	P25441	HSP60	YLR259C	1719 nt		11.35	□□□□□ -0.59
RPC53	P25441	GOR1	YNL274C	1053 nt		11.34	□□□□□ -0.59
RPC53	P25441	SGT2	YOR007C	1041 nt		11.34	□□□□□ -0.59
RPC53	P25441	DUT1	YBR252W	444 nt		11.34	□□□□□ -0.59
RPC53	P25441	NIT1	YIL164C	600 nt		11.33	□□□□□ -0.6
RPC53	P25441	YCL074W	YCL074W	927 nt		11.31	□□□□□ -0.6
RPC53	P25441	SHB17	YKR043C	816 nt		11.29	□□□□□ -0.6
RPC53	P25441	SBA1	YKL117W	651 nt		11.28	□□□□□ -0.6
RPC53	P25441	DAT1	YML113W	747 nt		11.28	□□□□□ -0.6
RPC53	P25441	UBA4	YHR111W	1323 nt		11.27	□□□□□ -0.61
RPC53	P25441	STR3	YGL184C	1398 nt		11.24	□□□□□ -0.61
RPC53	P25441	RDN18-1	RDN18-1	1800 nt		11.22	□□□□□ -0.61
RPC53	P25441	RDN18-2	RDN18-2	1800 nt		11.22	□□□□□ -0.61
RPC53	P25441	YSR3	YKR053C	1215 nt		11.21	□□□□□ -0.61
RPC53	P25441	PRP4	YPR178W	1398 nt		11.2	□□□□□ -0.62
RPC53	P25441	YDR010C	YDR010C	333 nt		11.2	□□□□□ -0.62
RPC53	P25441	YGL034C	YGL034C	366 nt		11.19	□□□□□ -0.62
RPC53	P25441	AQY2	YLL052C	450 nt		11.19	□□□□□ -0.62
RPC53	P25441	RET2	YFR051C	1641 nt		11.18	□□□□□ -0.62
RPC53	P25441	YCR102C	YCR102C	1107 nt		11.17	□□□□□ -0.62
RPC53	P25441	YKR005C	YKR005C	1578 nt		11.16	□□□□□ -0.62
RPC53	P25441	YCR087W	YCR087W	516 nt		11.16	□□□□□ -0.62
RPC53	P25441	PHO89	YBR296C	1725 nt		11.13	□□□□□ -0.63
RPC53	P25441	DPS1	YLL018C	1674 nt		11.13	□□□□□ -0.63
RPC53	P25441	YGR259C	YGR259C	441 nt		11.11	□□□□□ -0.63
RPC53	P25441	BMT6	YLR063W	1098 nt		11.1	□□□□□ -0.63
RPC53	P25441	XYL2	YLR070C	1071 nt		11.09	□□□□□ -0.63
RPC53	P25441	UME6	YDR207C	2511 nt		11.09	□□□□□ -0.63
RPC53	P25441	NBP35	YGL091C	987 nt		11.08	□□□□□ -0.64
RPC53	P25441	AIM45	YPR004C	1035 nt		11.05	□□□□□ -0.64
RPC53	P25441	RTN2	YDL204W	1182 nt		11.04	□□□□□ -0.64
RPC53	P25441	AAC1	YMR056C	930 nt		11.04	□□□□□ -0.64
RPC53	P25441	MRP20	YDR405W	792 nt		11.03	□□□□□ -0.64
RPC53	P25441	RBG1	YAL036C	1110 nt		11.03	□□□□□ -0.64
RPC53	P25441	NDI1	YML120C	1542 nt		11.03	□□□□□ -0.64
RPC53	P25441	GLR1	YPL091W	1452 nt		11.01	□□□□□ -0.65
RPC53	P25441	SFA1	YDL168W	1161 nt		11	□□□□□ -0.65
RPC53	P25441	YHL019W-A	YHL019W-A	594 nt		10.99	□□□□□ -0.65

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