Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms