Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms