Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms