Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPOLBQ9NRJ5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms