Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms