Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC40A1Q9NP59 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms