Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGQ9H9S0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGQ9H9S0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGQ9H9S0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGQ9H9S0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGQ9H9S0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGQ9H9S0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGQ9H9S0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGQ9H9S0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGQ9H9S0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGQ9H9S0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGQ9H9S0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGQ9H9S0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms