Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms