Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS2Q9BXC9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms