Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms