Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms