Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERAC1Q96JX3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms