Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00301Q8NCQ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms