Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFCAB12Q6NXP0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms