Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E7

TXNRD3NB, Protein TXNRD3NB, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3NBQ6F5E7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TXNRD3NBQ6F5E7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TXNRD3NBQ6F5E7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TXNRD3NBQ6F5E7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TXNRD3NBQ6F5E7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms