Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms