Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRAGBQ5VZM2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms