Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDRF1Q3B7T1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms