Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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