Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
EEA1Q15075 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
EEA1Q15075 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
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