Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTP4A2Q12974 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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