Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX5P78411 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX5P78411 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX5P78411 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX5P78411 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX5P78411 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX5P78411 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX5P78411 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX5P78411 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX5P78411 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX5P78411 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX5P78411 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX5P78411 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX5P78411 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX5P78411 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX5P78411 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX5P78411 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX5P78411 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX5P78411 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX5P78411 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX5P78411 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX5P78411 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX5P78411 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX5P78411 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX5P78411 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX5P78411 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX5P78411 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX5P78411 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX5P78411 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX5P78411 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX5P78411 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX5P78411 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX5P78411 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX5P78411 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX5P78411 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX5P78411 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX5P78411 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX5P78411 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX5P78411 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX5P78411 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX5P78411 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX5P78411 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX5P78411 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX5P78411 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX5P78411 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX5P78411 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX5P78411 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX5P78411 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX5P78411 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX5P78411 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX5P78411 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX5P78411 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX5P78411 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX5P78411 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX5P78411 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX5P78411 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX5P78411 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX5P78411 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX5P78411 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX5P78411 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX5P78411 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX5P78411 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX5P78411 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX5P78411 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX5P78411 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX5P78411 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
IRX5P78411 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IRX5P78411 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX5P78411 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX5P78411 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX5P78411 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX5P78411 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX5P78411 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX5P78411 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX5P78411 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX5P78411 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX5P78411 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX5P78411 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX5P78411 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX5P78411 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX5P78411 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX5P78411 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX5P78411 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX5P78411 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX5P78411 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX5P78411 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX5P78411 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX5P78411 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX5P78411 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX5P78411 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX5P78411 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX5P78411 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX5P78411 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX5P78411 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX5P78411 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX5P78411 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX5P78411 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX5P78411 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX5P78411 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX5P78411 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms