Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP54P61011 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP54P61011 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP54P61011 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP54P61011 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP54P61011 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP54P61011 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP54P61011 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP54P61011 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP54P61011 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP54P61011 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP54P61011 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP54P61011 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP54P61011 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP54P61011 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP54P61011 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP54P61011 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP54P61011 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP54P61011 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP54P61011 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP54P61011 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP54P61011 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP54P61011 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP54P61011 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP54P61011 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP54P61011 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP54P61011 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP54P61011 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP54P61011 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP54P61011 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP54P61011 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP54P61011 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP54P61011 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP54P61011 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP54P61011 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP54P61011 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP54P61011 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP54P61011 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP54P61011 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP54P61011 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP54P61011 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP54P61011 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP54P61011 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP54P61011 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRP54P61011 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP54P61011 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP54P61011 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP54P61011 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP54P61011 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP54P61011 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP54P61011 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP54P61011 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP54P61011 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP54P61011 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP54P61011 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP54P61011 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP54P61011 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP54P61011 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP54P61011 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP54P61011 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP54P61011 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP54P61011 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP54P61011 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP54P61011 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP54P61011 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP54P61011 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP54P61011 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP54P61011 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP54P61011 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP54P61011 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP54P61011 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP54P61011 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP54P61011 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP54P61011 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP54P61011 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP54P61011 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP54P61011 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP54P61011 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP54P61011 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP54P61011 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP54P61011 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP54P61011 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP54P61011 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP54P61011 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP54P61011 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP54P61011 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP54P61011 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP54P61011 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP54P61011 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP54P61011 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP54P61011 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP54P61011 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP54P61011 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP54P61011 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP54P61011 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP54P61011 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP54P61011 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP54P61011 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP54P61011 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP54P61011 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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