Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMP3P54852 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMP3P54852 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMP3P54852 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMP3P54852 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMP3P54852 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMP3P54852 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMP3P54852 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMP3P54852 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMP3P54852 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMP3P54852 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EMP3P54852 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMP3P54852 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMP3P54852 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMP3P54852 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMP3P54852 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMP3P54852 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMP3P54852 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMP3P54852 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMP3P54852 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMP3P54852 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMP3P54852 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMP3P54852 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EMP3P54852 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMP3P54852 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMP3P54852 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMP3P54852 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMP3P54852 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMP3P54852 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMP3P54852 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EMP3P54852 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMP3P54852 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMP3P54852 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMP3P54852 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMP3P54852 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EMP3P54852 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMP3P54852 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMP3P54852 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMP3P54852 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMP3P54852 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMP3P54852 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMP3P54852 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMP3P54852 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMP3P54852 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMP3P54852 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMP3P54852 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMP3P54852 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMP3P54852 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMP3P54852 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EMP3P54852 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMP3P54852 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMP3P54852 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMP3P54852 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMP3P54852 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMP3P54852 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMP3P54852 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMP3P54852 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMP3P54852 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMP3P54852 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMP3P54852 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMP3P54852 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMP3P54852 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMP3P54852 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMP3P54852 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMP3P54852 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMP3P54852 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMP3P54852 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMP3P54852 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMP3P54852 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMP3P54852 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMP3P54852 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMP3P54852 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMP3P54852 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMP3P54852 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMP3P54852 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMP3P54852 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMP3P54852 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMP3P54852 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EMP3P54852 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMP3P54852 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMP3P54852 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMP3P54852 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMP3P54852 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMP3P54852 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMP3P54852 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMP3P54852 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EMP3P54852 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMP3P54852 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMP3P54852 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMP3P54852 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMP3P54852 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMP3P54852 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMP3P54852 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EMP3P54852 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMP3P54852 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EMP3P54852 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMP3P54852 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMP3P54852 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMP3P54852 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMP3P54852 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms