Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A3P48751 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC4A3P48751 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC4A3P48751 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC4A3P48751 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC4A3P48751 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A3P48751 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms