Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RXRAP19793 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RXRAP19793 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RXRAP19793 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RXRAP19793 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RXRAP19793 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RXRAP19793 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RXRAP19793 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RXRAP19793 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RXRAP19793 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RXRAP19793 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RXRAP19793 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RXRAP19793 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RXRAP19793 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RXRAP19793 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RXRAP19793 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RXRAP19793 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RXRAP19793 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RXRAP19793 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RXRAP19793 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RXRAP19793 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RXRAP19793 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RXRAP19793 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RXRAP19793 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RXRAP19793 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RXRAP19793 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RXRAP19793 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RXRAP19793 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RXRAP19793 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RXRAP19793 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RXRAP19793 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RXRAP19793 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RXRAP19793 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RXRAP19793 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RXRAP19793 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RXRAP19793 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RXRAP19793 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RXRAP19793 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RXRAP19793 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RXRAP19793 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RXRAP19793 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RXRAP19793 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RXRAP19793 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RXRAP19793 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RXRAP19793 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RXRAP19793 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RXRAP19793 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RXRAP19793 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RXRAP19793 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RXRAP19793 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RXRAP19793 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RXRAP19793 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RXRAP19793 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RXRAP19793 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RXRAP19793 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RXRAP19793 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RXRAP19793 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RXRAP19793 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RXRAP19793 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RXRAP19793 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RXRAP19793 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RXRAP19793 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RXRAP19793 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RXRAP19793 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RXRAP19793 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RXRAP19793 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RXRAP19793 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RXRAP19793 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RXRAP19793 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RXRAP19793 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RXRAP19793 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RXRAP19793 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RXRAP19793 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RXRAP19793 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RXRAP19793 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RXRAP19793 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RXRAP19793 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RXRAP19793 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RXRAP19793 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RXRAP19793 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RXRAP19793 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RXRAP19793 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RXRAP19793 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RXRAP19793 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RXRAP19793 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RXRAP19793 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RXRAP19793 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RXRAP19793 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RXRAP19793 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RXRAP19793 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RXRAP19793 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RXRAP19793 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RXRAP19793 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RXRAP19793 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RXRAP19793 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RXRAP19793 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RXRAP19793 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RXRAP19793 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RXRAP19793 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RXRAP19793 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms