Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGKV1-13P0DP09 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGKV1-13P0DP09 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV1-13P0DP09 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms