Protein–RNA interactions for Protein: O95198

KLHL2, Kelch-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL2O95198 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL2O95198 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL2O95198 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms