Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRK9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRK9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRK9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRK9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRK9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRK9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRK9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRK9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRK9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRK9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRK9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRK9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRK9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRK9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRK9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRK9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRK9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRK9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRK9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRK9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRK9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRK9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRK9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRK9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRK9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRK9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRK9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRK9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRK9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRK9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRK9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRK9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRK9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRK9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRK9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRK9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRK9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRK9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRK9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRK9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRK9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRK9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRK9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QRK9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QRK9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QRK9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QRK9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QRK9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QRK9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QRK9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QRK9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QRK9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
J3QRK9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
J3QRK9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
J3QRK9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRK9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRK9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRK9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRK9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRK9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRK9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRK9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRK9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRK9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRK9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRK9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRK9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRK9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRK9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRK9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRK9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRK9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRK9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRK9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRK9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRK9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRK9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRK9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRK9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRK9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms