Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCBP2LA6PVI3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCBP2LA6PVI3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCBP2LA6PVI3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCBP2LA6PVI3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCBP2LA6PVI3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCBP2LA6PVI3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCBP2LA6PVI3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCBP2LA6PVI3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCBP2LA6PVI3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCBP2LA6PVI3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCBP2LA6PVI3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCBP2LA6PVI3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.1 ms