Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMC4Q9NTJ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms