Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNHG12Q9BXW3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms